Protein–RNA interactions for Protein: P23396

RPS3, 40S ribosomal protein S3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3P23396 APOA1-202ENST00000359492 932 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.327e-88■■■■■ 39.4
RPS3P23396 UQCRC1-207ENST00000471189 955 ntTSL 312.8□□□□□ -0.369e-8■■■■■ 39.3
RPS3P23396 EIF4A3-207ENST00000576547 553 ntTSL 318.83■□□□□ 0.61e-8■■■■■ 39.2
RPS3P23396 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.92e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.542e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 MEN1-215ENST00000478548 1341 ntTSL 223.34■■□□□ 1.332e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 TP53I13-206ENST00000579674 2468 nt19.62■□□□□ 0.732e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 C4A-257ENST00000491876 880 ntTSL 219.35■□□□□ 0.692e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 C4A-252ENST00000471624 583 ntTSL 218.74■□□□□ 0.592e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC17.57■□□□□ 0.42e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.71■□□□□ 0.272e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 SCPEP1-215ENST00000576154 1915 ntTSL 216.68■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 C4A-246ENST00000463034 1174 ntTSL 516.66■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.132e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.82■□□□□ 0.122e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 SCPEP1-214ENST00000575423 1725 ntTSL 214.78□□□□□ -0.042e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.072e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 SCPEP1-210ENST00000573239 930 ntTSL 214.61□□□□□ -0.072e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 PCOLCE-204ENST00000468214 541 ntTSL 414.49□□□□□ -0.093e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.126e-8■■■■■ 39.2
RPS3P23396 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC14.27□□□□□ -0.132e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 C4A-251ENST00000470365 554 ntTSL 314.24□□□□□ -0.132e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 SERPINE2-204ENST00000423446 581 ntTSL 413.24□□□□□ -0.292e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 AL109615.2-201ENST00000455005 1608 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.372e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 C4A-244ENST00000460060 628 ntTSL 312.58□□□□□ -0.42e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 SCPEP1-202ENST00000570479 924 ntTSL 212.21□□□□□ -0.452e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 PCOLCE-202ENST00000460002 447 ntTSL 312.19□□□□□ -0.463e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 TMEM184C-201ENST00000296582 4178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.712e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 NUP188-201ENST00000372577 5689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.786e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 PCOLCE-209ENST00000490909 318 ntTSL 28.06□□□□□ -1.123e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.592e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.876e-8■■■■■ 39.2
RPS3P23396 OXA1L-204ENST00000431881 889 ntTSL 315.32■□□□□ 0.044e-20■■■■■ 39.2
RPS3P23396 OXA1L-205ENST00000442110 691 ntTSL 514.49□□□□□ -0.094e-20■■■■■ 39.2
RPS3P23396 OXA1L-208ENST00000483939 1224 ntTSL 212.78□□□□□ -0.364e-20■■■■■ 39.2
RPS3P23396 OXA1L-206ENST00000473744 824 ntTSL 310.74□□□□□ -0.694e-20■■■■■ 39.2
RPS3P23396 OXA1L-210ENST00000556473 593 ntTSL 410.41□□□□□ -0.744e-20■■■■■ 39.2
RPS3P23396 MTRNR2L1-201ENST00000540040 1553 ntAPPRIS P1 BASIC8.96□□□□□ -0.972e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.833e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.763e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 TSSC4-206ENST00000440813 851 ntAPPRIS ALT2 TSL 319.75■□□□□ 0.753e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 MIEF1-214ENST00000494219 592 ntTSL 219.55■□□□□ 0.723e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.73e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 SHROOM1-204ENST00000440118 1080 ntTSL 219.17■□□□□ 0.663e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.663e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 PSMC3-203ENST00000526993 580 ntTSL 218.91■□□□□ 0.623e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.562e-8■■■■■ 39.2
RPS3P23396 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.543e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 MIEF1-213ENST00000489792 590 ntTSL 418.41■□□□□ 0.543e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 TSSC4-210ENST00000496468 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)18.09■□□□□ 0.493e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 MT1F-202ENST00000564295 1573 nt18.04■□□□□ 0.483e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.443e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 AQP11-202ENST00000528638 1202 ntTSL 1 (best)17.72■□□□□ 0.433e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 APH1A-201ENST00000236017 663 ntTSL 217.29■□□□□ 0.363e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.343e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 TSSC4-209ENST00000485682 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 217.11■□□□□ 0.333e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 TSSC4-205ENST00000437110 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 216.7■□□□□ 0.263e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 MIEF1-209ENST00000467866 573 ntTSL 416.59■□□□□ 0.253e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.222e-8■■■■■ 39.2
RPS3P23396 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.193e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.193e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.143e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.133e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 MIEF1-206ENST00000434364 744 ntTSL 515.59■□□□□ 0.093e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 MIEF1-212ENST00000481746 559 ntTSL 415.53■□□□□ 0.083e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 MIEF1-210ENST00000478342 700 ntTSL 215.53■□□□□ 0.083e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 TSSC4-204ENST00000435795 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 315.42■□□□□ 0.063e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -03e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 MIEF1-204ENST00000428069 1379 ntTSL 214.8□□□□□ -0.043e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.053e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 HSPA13-202ENST00000478035 620 ntTSL 314.53□□□□□ -0.083e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.183e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.213e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 MIEF1-207ENST00000464629 573 ntTSL 413.53□□□□□ -0.243e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 MT1F-201ENST00000334350 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.313e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 TIMM10-201ENST00000257245 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.413e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 MIEF1-205ENST00000433117 3838 ntTSL 1 (best)12.41□□□□□ -0.423e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.423e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 BUB3-204ENST00000407911 895 ntTSL 1 (best)12.37□□□□□ -0.433e-8■■■■■ 39.2
RPS3P23396 APH1A-209ENST00000493092 585 ntTSL 312.27□□□□□ -0.453e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 EDF1-201ENST00000224073 640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.463e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 MIEF1-201ENST00000325301 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.523e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 APH1A-205ENST00000461320 1038 ntTSL 311.81□□□□□ -0.523e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 PSMC3-205ENST00000528362 546 ntTSL 211.41□□□□□ -0.582e-8■■■■■ 39.2
RPS3P23396 MT1F-204ENST00000568475 416 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.593e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 MIEF1-203ENST00000404569 3797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.25□□□□□ -0.613e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 MIEF1-208ENST00000465564 363 ntTSL 310.69□□□□□ -0.73e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 KIF1B-212ENST00000622724 8588 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.733e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 PSMC3-211ENST00000531653 498 ntTSL 210.35□□□□□ -0.752e-8■■■■■ 39.2
RPS3P23396 GART-203ENST00000381815 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.753e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 TIMM10-203ENST00000525587 486 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.843e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 KIF1B-211ENST00000620295 8624 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.973e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 KIF1B-202ENST00000377081 8746 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.113e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 KIF1B-201ENST00000263934 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.72□□□□□ -1.173e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 GART-206ENST00000424203 3571 ntTSL 1 (best)7.57□□□□□ -1.23e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 BUB3-203ENST00000368865 7828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.212e-8■■■■■ 39.2
RPS3P23396 GART-204ENST00000381831 3490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.273e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.323e-7■■■■■ 39.2
RPS3P23396 PSMB4-202ENST00000466425 665 ntTSL 26.53□□□□□ -1.362e-13■■■■■ 39.2
RPS3P23396 GGH-203ENST00000518466 696 ntTSL 35.91□□□□□ -1.463e-7■■■■■ 39.2
Retrieved 100 of 24,271 protein–RNA pairs in 212.4 ms