RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428069.1

MIEF1-204, Transcript of mitochondrial elongation factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene MIEF1, Length 1,379 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIEF1-204ENST00000428069 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.93■■■■□ 3.82
MIEF1-204ENST00000428069 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa35.1■■■■□ 3.21
MIEF1-204ENST00000428069 ABCC9O60706 1549 aa34.61■■■■□ 3.13
MIEF1-204ENST00000428069 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa33.19■■■□□ 2.9
MIEF1-204ENST00000428069 NACADO15069 1562 aa33.02■■■□□ 2.88
MIEF1-204ENST00000428069 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.7■■■□□ 2.83
MIEF1-204ENST00000428069 UNC13AQ9UPW8 1703 aa32.63■■■□□ 2.81
MIEF1-204ENST00000428069 DNAJC5BQ9UF47 199 aa32.54■■■□□ 2.8
MIEF1-204ENST00000428069 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.35■■■□□ 2.77
MIEF1-204ENST00000428069 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.34■■■□□ 2.77
MIEF1-204ENST00000428069 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.31■■■□□ 2.76
MIEF1-204ENST00000428069 BICRAQ9NZM4 1560 aa32.27■■■□□ 2.76
MIEF1-204ENST00000428069 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP32.08■■■□□ 2.73
MIEF1-204ENST00000428069 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.93■■■□□ 2.7
MIEF1-204ENST00000428069 SCRIBQ14160 1630 aa31.75■■■□□ 2.67
MIEF1-204ENST00000428069 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa31.43■■■□□ 2.62
MIEF1-204ENST00000428069 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP31.41■■■□□ 2.62
MIEF1-204ENST00000428069 CECR2Q9BXF3 1484 aa31.21■■■□□ 2.59
MIEF1-204ENST00000428069 NCAPD3P42695 1498 aa30.42■■■□□ 2.46
MIEF1-204ENST00000428069 SMARCA4P51532 1647 aa30.41■■■□□ 2.46
MIEF1-204ENST00000428069 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.31■■■□□ 2.44
MIEF1-204ENST00000428069 HMGXB3Q12766 1538 aa30.3■■■□□ 2.44
MIEF1-204ENST00000428069 SMARCA2P51531 1590 aa30.3■■■□□ 2.44
MIEF1-204ENST00000428069 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
MIEF1-204ENST00000428069 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.21■■■□□ 2.43
MIEF1-204ENST00000428069 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa30.11■■■□□ 2.41
MIEF1-204ENST00000428069 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
MIEF1-204ENST00000428069 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.97■■■□□ 2.39
MIEF1-204ENST00000428069 CUX2O14529 1486 aa29.93■■■□□ 2.38
MIEF1-204ENST00000428069 ERCC6Q03468 1493 aa29.87■■■□□ 2.37
MIEF1-204ENST00000428069 NESP48681 1621 aa29.81■■■□□ 2.36
MIEF1-204ENST00000428069 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29.79■■■□□ 2.36
MIEF1-204ENST00000428069 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP29.69■■■□□ 2.34
MIEF1-204ENST00000428069 WIZO95785 1651 aa29.66■■■□□ 2.34
MIEF1-204ENST00000428069 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa29.62■■■□□ 2.33
MIEF1-204ENST00000428069 PDS5BQ9NTI5 1447 aa29.44■■■□□ 2.3
MIEF1-204ENST00000428069 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.41■■■□□ 2.3
MIEF1-204ENST00000428069 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
MIEF1-204ENST00000428069 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
MIEF1-204ENST00000428069 WDR62O43379 1518 aa29.27■■■□□ 2.28
MIEF1-204ENST00000428069 MRC2Q9UBG0 1479 aa29.25■■■□□ 2.27
MIEF1-204ENST00000428069 CFTRP13569 1480 aa29.19■■■□□ 2.26
MIEF1-204ENST00000428069 PRDM2Q13029 1718 aa29.19■■■□□ 2.26
MIEF1-204ENST00000428069 CEP164Q9UPV0 1460 aa29.14■■■□□ 2.26
MIEF1-204ENST00000428069 FANCD2Q9BXW9 1451 aa29.1■■■□□ 2.25
MIEF1-204ENST00000428069 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
MIEF1-204ENST00000428069 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.86■■■□□ 2.21
MIEF1-204ENST00000428069 TOPBP1Q92547 1522 aa28.6■■■□□ 2.17
MIEF1-204ENST00000428069 ABCC8Q09428 1581 aa28.58■■■□□ 2.17
MIEF1-204ENST00000428069 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.57■■■□□ 2.16
MIEF1-204ENST00000428069 IFT140Q96RY7 1462 aa28.56■■■□□ 2.16
MIEF1-204ENST00000428069 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.15
MIEF1-204ENST00000428069 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
MIEF1-204ENST00000428069 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.45■■■□□ 2.14
MIEF1-204ENST00000428069 TRIM41Q8WV44 630 aa28.41■■■□□ 2.14
MIEF1-204ENST00000428069 OSCARQ8IYS5 282 aa28.36■■■□□ 2.13
MIEF1-204ENST00000428069 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
MIEF1-204ENST00000428069 CHD1O14646 1710 aa28.26■■■□□ 2.11
MIEF1-204ENST00000428069 WDR97A6NE52 1622 aa28.25■■■□□ 2.11
MIEF1-204ENST00000428069 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa28.21■■■□□ 2.11
MIEF1-204ENST00000428069 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa28.21■■■□□ 2.11
MIEF1-204ENST00000428069 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa28.21■■■□□ 2.11
MIEF1-204ENST00000428069 CUX1P39880 1505 aa28.17■■■□□ 2.1
MIEF1-204ENST00000428069 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP28.15■■■□□ 2.17e-7■■■■□ 24.7
MIEF1-204ENST00000428069 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.13■■■□□ 2.09
MIEF1-204ENST00000428069 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.11■■■□□ 2.09
MIEF1-204ENST00000428069 ARHGEF11O15085 1522 aa28.09■■■□□ 2.09
MIEF1-204ENST00000428069 SOGA1O94964 1423 aa28.08■■■□□ 2.09
MIEF1-204ENST00000428069 PBRM1Q86U86 1689 aa27.99■■■□□ 2.07
MIEF1-204ENST00000428069 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.95■■■□□ 2.07
MIEF1-204ENST00000428069 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.95■■■□□ 2.06
MIEF1-204ENST00000428069 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.94■■■□□ 2.06
MIEF1-204ENST00000428069 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.92■■■□□ 2.06
MIEF1-204ENST00000428069 GRIN2BQ13224 1484 aa27.9■■■□□ 2.06
MIEF1-204ENST00000428069 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.9■■■□□ 2.06
MIEF1-204ENST00000428069 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.89■■■□□ 2.05
MIEF1-204ENST00000428069 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.87■■■□□ 2.05
MIEF1-204ENST00000428069 SYNJ1O43426 1573 aa27.84■■■□□ 2.05
MIEF1-204ENST00000428069 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
MIEF1-204ENST00000428069 TOP2BQ02880 1626 aa27.82■■■□□ 2.04
MIEF1-204ENST00000428069 SYNJ2O15056 1496 aa27.82■■■□□ 2.04
MIEF1-204ENST00000428069 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.81■■■□□ 2.04
MIEF1-204ENST00000428069 ARAP1Q96P48 1450 aa27.81■■■□□ 2.04
MIEF1-204ENST00000428069 FBLN2P98095 1184 aa27.74■■■□□ 2.03
MIEF1-204ENST00000428069 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP27.69■■■□□ 2.02
MIEF1-204ENST00000428069 ADAMTS12P58397 1594 aa27.66■■■□□ 2.02
MIEF1-204ENST00000428069 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.65■■■□□ 2.02
MIEF1-204ENST00000428069 CYB5RLQ6IPT4 315 aa27.61■■■□□ 2.01
MIEF1-204ENST00000428069 GRIN2AQ12879 1464 aa27.57■■■□□ 2
MIEF1-204ENST00000428069 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.56■■■□□ 2
MIEF1-204ENST00000428069 CEP170Q5SW79 1584 aa27.51■■□□□ 1.99
MIEF1-204ENST00000428069 NUP160Q12769 1436 aa27.5■■□□□ 1.99
MIEF1-204ENST00000428069 SHROOM2Q13796 1616 aa27.49■■□□□ 1.99
MIEF1-204ENST00000428069 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.46■■□□□ 1.99
MIEF1-204ENST00000428069 ERCC6L2Q5T890 1561 aa27.38■■□□□ 1.97
MIEF1-204ENST00000428069 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.29■■□□□ 1.96
MIEF1-204ENST00000428069 CUL7Q14999 1698 aa27.24■■□□□ 1.95
MIEF1-204ENST00000428069 TRHP20396 242 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
MIEF1-204ENST00000428069 KIF27Q86VH2 1401 aa27.12■■□□□ 1.93
MIEF1-204ENST00000428069 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP27.1■■□□□ 1.93
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