RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000257245.8

TIMM10-201, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TIMM10, Length 680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM10-201ENST00000257245 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP35.25■■■■□ 3.23
TIMM10-201ENST00000257245 CHIC1Q5VXU3 224 aa34.08■■■■□ 3.05
TIMM10-201ENST00000257245 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP30.24■■■□□ 2.43
TIMM10-201ENST00000257245 NISCHQ9Y2I1 1504 aa30.11■■■□□ 2.41
TIMM10-201ENST00000257245 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP29.79■■■□□ 2.36
TIMM10-201ENST00000257245 FOXD1Q16676 465 aa27.96■■■□□ 2.07
TIMM10-201ENST00000257245 PLPPR3Q6T4P5 718 aa27.54■■■□□ 2
TIMM10-201ENST00000257245 ABCC9O60706 1549 aa27.36■■□□□ 1.97
TIMM10-201ENST00000257245 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa27.05■■□□□ 1.92
TIMM10-201ENST00000257245 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.42■■□□□ 1.82
TIMM10-201ENST00000257245 ADRA2BP18089 450 aa26.4■■□□□ 1.82
TIMM10-201ENST00000257245 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
TIMM10-201ENST00000257245 MSH5O43196 834 aa26.19■■□□□ 1.78
TIMM10-201ENST00000257245 DNAJC5BQ9UF47 199 aa25.87■■□□□ 1.73
TIMM10-201ENST00000257245 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.85■■□□□ 1.73
TIMM10-201ENST00000257245 NACADO15069 1562 aa25.61■■□□□ 1.69
TIMM10-201ENST00000257245 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.51■■□□□ 1.67
TIMM10-201ENST00000257245 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.45■■□□□ 1.66
TIMM10-201ENST00000257245 UNC13AQ9UPW8 1703 aa25.34■■□□□ 1.65
TIMM10-201ENST00000257245 BICRAQ9NZM4 1560 aa25.18■■□□□ 1.62
TIMM10-201ENST00000257245 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
TIMM10-201ENST00000257245 MYO15BQ96JP2 1530 aa25.12■■□□□ 1.61
TIMM10-201ENST00000257245 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.95■■□□□ 1.58
TIMM10-201ENST00000257245 SCRIBQ14160 1630 aa24.75■■□□□ 1.55
TIMM10-201ENST00000257245 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.68■■□□□ 1.54
TIMM10-201ENST00000257245 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa24.68■■□□□ 1.54
TIMM10-201ENST00000257245 CECR2Q9BXF3 1484 aa24.63■■□□□ 1.53
TIMM10-201ENST00000257245 POTEDQ86YR6 584 aa24.58■■□□□ 1.53
TIMM10-201ENST00000257245 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
TIMM10-201ENST00000257245 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
TIMM10-201ENST00000257245 PPP4R3CPQ6ZMV5 832 aa24.11■■□□□ 1.45
TIMM10-201ENST00000257245 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
TIMM10-201ENST00000257245 DMRT2Q9Y5R5 561 aa24■■□□□ 1.43
TIMM10-201ENST00000257245 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa23.81■■□□□ 1.4
TIMM10-201ENST00000257245 NCAPD3P42695 1498 aa23.64■■□□□ 1.38
TIMM10-201ENST00000257245 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa23.63■■□□□ 1.37
TIMM10-201ENST00000257245 ERCC6Q03468 1493 aa23.59■■□□□ 1.37
TIMM10-201ENST00000257245 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.59■■□□□ 1.37
TIMM10-201ENST00000257245 CUX2O14529 1486 aa23.57■■□□□ 1.36
TIMM10-201ENST00000257245 SMARCA4P51532 1647 aa23.53■■□□□ 1.36
TIMM10-201ENST00000257245 NCBP3Q53F19 620 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
TIMM10-201ENST00000257245 HMGXB3Q12766 1538 aa23.47■■□□□ 1.35
TIMM10-201ENST00000257245 SMARCA2P51531 1590 aa23.47■■□□□ 1.35
TIMM10-201ENST00000257245 NESP48681 1621 aa23.47■■□□□ 1.35
TIMM10-201ENST00000257245 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
TIMM10-201ENST00000257245 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
TIMM10-201ENST00000257245 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
TIMM10-201ENST00000257245 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP23.29■■□□□ 1.32
TIMM10-201ENST00000257245 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.24■■□□□ 1.31
TIMM10-201ENST00000257245 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
TIMM10-201ENST00000257245 MROH2BQ7Z745 1585 aa23.22■■□□□ 1.31
TIMM10-201ENST00000257245 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa23.14■■□□□ 1.3
TIMM10-201ENST00000257245 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa23.13■■□□□ 1.29
TIMM10-201ENST00000257245 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
TIMM10-201ENST00000257245 PDS5BQ9NTI5 1447 aa23■■□□□ 1.27
TIMM10-201ENST00000257245 WIZO95785 1651 aa22.98■■□□□ 1.27
TIMM10-201ENST00000257245 DCAF8L1A6NGE4 600 aa22.97■■□□□ 1.27
TIMM10-201ENST00000257245 NPM3O75607 178 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
TIMM10-201ENST00000257245 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.92■■□□□ 1.26
TIMM10-201ENST00000257245 KCNA4P22459 653 aa22.9■■□□□ 1.26
TIMM10-201ENST00000257245 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.88■■□□□ 1.25
TIMM10-201ENST00000257245 WDR62O43379 1518 aa22.83■■□□□ 1.25
TIMM10-201ENST00000257245 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
TIMM10-201ENST00000257245 TRIM41Q8WV44 630 aa22.77■■□□□ 1.24
TIMM10-201ENST00000257245 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.74■■□□□ 1.23
TIMM10-201ENST00000257245 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
TIMM10-201ENST00000257245 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.71■■□□□ 1.23
TIMM10-201ENST00000257245 CFTRP13569 1480 aa22.63■■□□□ 1.21
TIMM10-201ENST00000257245 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
TIMM10-201ENST00000257245 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.46■■□□□ 1.19
TIMM10-201ENST00000257245 OSCARQ8IYS5 282 aa22.44■■□□□ 1.18
TIMM10-201ENST00000257245 PRDM2Q13029 1718 aa22.39■■□□□ 1.17
TIMM10-201ENST00000257245 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
TIMM10-201ENST00000257245 RNF39Q9H2S5 420 aa22.28■■□□□ 1.16
TIMM10-201ENST00000257245 IFT140Q96RY7 1462 aa22.28■■□□□ 1.16
TIMM10-201ENST00000257245 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa22.27■■□□□ 1.16
TIMM10-201ENST00000257245 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa22.27■■□□□ 1.16
TIMM10-201ENST00000257245 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa22.27■■□□□ 1.16
TIMM10-201ENST00000257245 TOPBP1Q92547 1522 aa22.26■■□□□ 1.15
TIMM10-201ENST00000257245 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.23■■□□□ 1.15
TIMM10-201ENST00000257245 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
TIMM10-201ENST00000257245 ARHGEF11O15085 1522 aa22.16■■□□□ 1.14
TIMM10-201ENST00000257245 DNMBPQ6XZF7 1577 aa22.14■■□□□ 1.13
TIMM10-201ENST00000257245 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
TIMM10-201ENST00000257245 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP22.09■■□□□ 1.13
TIMM10-201ENST00000257245 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
TIMM10-201ENST00000257245 ABCC8Q09428 1581 aa22.08■■□□□ 1.13
TIMM10-201ENST00000257245 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
TIMM10-201ENST00000257245 CHD1O14646 1710 aa22.07■■□□□ 1.12
TIMM10-201ENST00000257245 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
TIMM10-201ENST00000257245 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22■■□□□ 1.11
TIMM10-201ENST00000257245 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.99■■□□□ 1.11
TIMM10-201ENST00000257245 FBLN2P98095 1184 aa21.98■■□□□ 1.11
TIMM10-201ENST00000257245 ARAP1Q96P48 1450 aa21.96■■□□□ 1.11
TIMM10-201ENST00000257245 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.92■■□□□ 1.1
TIMM10-201ENST00000257245 SOGA1O94964 1423 aa21.89■■□□□ 1.09
TIMM10-201ENST00000257245 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.87■■□□□ 1.09
TIMM10-201ENST00000257245 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.86■■□□□ 1.09
TIMM10-201ENST00000257245 CUX1P39880 1505 aa21.82■■□□□ 1.08
TIMM10-201ENST00000257245 TRHP20396 242 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms