Protein–RNA interactions for Protein: P12814

ACTN1, Alpha-actinin-1, humanhuman

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN1P12814 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ACTN1P12814 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ACTN1P12814 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ACTN1P12814 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
ACTN1P12814 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ACTN1P12814 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ACTN1P12814 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ACTN1P12814 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ACTN1P12814 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ACTN1P12814 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ACTN1P12814 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ACTN1P12814 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ACTN1P12814 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ACTN1P12814 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ACTN1P12814 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ACTN1P12814 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ACTN1P12814 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ACTN1P12814 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ACTN1P12814 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ACTN1P12814 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ACTN1P12814 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ACTN1P12814 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ACTN1P12814 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ACTN1P12814 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ACTN1P12814 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACTN1P12814 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACTN1P12814 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACTN1P12814 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACTN1P12814 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACTN1P12814 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACTN1P12814 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ACTN1P12814 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACTN1P12814 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACTN1P12814 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACTN1P12814 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ACTN1P12814 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACTN1P12814 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ACTN1P12814 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACTN1P12814 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACTN1P12814 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACTN1P12814 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACTN1P12814 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ACTN1P12814 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ACTN1P12814 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ACTN1P12814 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ACTN1P12814 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ACTN1P12814 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ACTN1P12814 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ACTN1P12814 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ACTN1P12814 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ACTN1P12814 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ACTN1P12814 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ACTN1P12814 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ACTN1P12814 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ACTN1P12814 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ACTN1P12814 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ACTN1P12814 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ACTN1P12814 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ACTN1P12814 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ACTN1P12814 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ACTN1P12814 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ACTN1P12814 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ACTN1P12814 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ACTN1P12814 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ACTN1P12814 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ACTN1P12814 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ACTN1P12814 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACTN1P12814 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACTN1P12814 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACTN1P12814 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACTN1P12814 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACTN1P12814 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACTN1P12814 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACTN1P12814 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACTN1P12814 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACTN1P12814 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACTN1P12814 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ACTN1P12814 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACTN1P12814 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACTN1P12814 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACTN1P12814 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACTN1P12814 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACTN1P12814 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACTN1P12814 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACTN1P12814 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACTN1P12814 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ACTN1P12814 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ACTN1P12814 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ACTN1P12814 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ACTN1P12814 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
ACTN1P12814 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ACTN1P12814 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ACTN1P12814 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACTN1P12814 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACTN1P12814 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACTN1P12814 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACTN1P12814 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACTN1P12814 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACTN1P12814 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ACTN1P12814 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms