Protein–RNA interactions for Protein: A6NHQ4

EPOP, Elongin BC and Polycomb repressive complex 2-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPOPA6NHQ4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
EPOPA6NHQ4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EPOPA6NHQ4 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EPOPA6NHQ4 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EPOPA6NHQ4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EPOPA6NHQ4 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
EPOPA6NHQ4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
EPOPA6NHQ4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EPOPA6NHQ4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
EPOPA6NHQ4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EPOPA6NHQ4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EPOPA6NHQ4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EPOPA6NHQ4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EPOPA6NHQ4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EPOPA6NHQ4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EPOPA6NHQ4 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
EPOPA6NHQ4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EPOPA6NHQ4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
EPOPA6NHQ4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
EPOPA6NHQ4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EPOPA6NHQ4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EPOPA6NHQ4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
EPOPA6NHQ4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
EPOPA6NHQ4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
EPOPA6NHQ4 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EPOPA6NHQ4 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EPOPA6NHQ4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EPOPA6NHQ4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EPOPA6NHQ4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
EPOPA6NHQ4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EPOPA6NHQ4 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EPOPA6NHQ4 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
EPOPA6NHQ4 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EPOPA6NHQ4 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
EPOPA6NHQ4 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EPOPA6NHQ4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
EPOPA6NHQ4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EPOPA6NHQ4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EPOPA6NHQ4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EPOPA6NHQ4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
EPOPA6NHQ4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
EPOPA6NHQ4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EPOPA6NHQ4 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EPOPA6NHQ4 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
EPOPA6NHQ4 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
EPOPA6NHQ4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EPOPA6NHQ4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
EPOPA6NHQ4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
EPOPA6NHQ4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EPOPA6NHQ4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
EPOPA6NHQ4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
EPOPA6NHQ4 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPOPA6NHQ4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPOPA6NHQ4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPOPA6NHQ4 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPOPA6NHQ4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPOPA6NHQ4 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPOPA6NHQ4 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
EPOPA6NHQ4 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
EPOPA6NHQ4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
EPOPA6NHQ4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
EPOPA6NHQ4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPOPA6NHQ4 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPOPA6NHQ4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPOPA6NHQ4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPOPA6NHQ4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
EPOPA6NHQ4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
EPOPA6NHQ4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
EPOPA6NHQ4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EPOPA6NHQ4 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EPOPA6NHQ4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EPOPA6NHQ4 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EPOPA6NHQ4 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EPOPA6NHQ4 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
EPOPA6NHQ4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EPOPA6NHQ4 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
EPOPA6NHQ4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPOPA6NHQ4 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPOPA6NHQ4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPOPA6NHQ4 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
EPOPA6NHQ4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EPOPA6NHQ4 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EPOPA6NHQ4 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
EPOPA6NHQ4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
EPOPA6NHQ4 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
EPOPA6NHQ4 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPOPA6NHQ4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPOPA6NHQ4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPOPA6NHQ4 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
EPOPA6NHQ4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPOPA6NHQ4 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPOPA6NHQ4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
EPOPA6NHQ4 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPOPA6NHQ4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPOPA6NHQ4 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
EPOPA6NHQ4 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
EPOPA6NHQ4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPOPA6NHQ4 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPOPA6NHQ4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
EPOPA6NHQ4 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms