Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 GTF2I-212ENST00000573035 4548 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
LINC01547P58512 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms