RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617028.1

SPEG-225, Transcript of SPEG complex locus, human

TSL 5 BASIC

Gene SPEG, Length 815 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPEG-225	ENST00000617028	NISCH	Q9Y2I1	1504 aa		44.49	■■■■■ 4.71
SPEG-225	ENST00000617028	CCDC180	Q9P1Z9	1646 aa		39.62	■■■■□ 3.93
SPEG-225	ENST00000617028	ABCC9	O60706	1549 aa		38.73	■■■■□ 3.79
SPEG-225	ENST00000617028	RB1CC1	Q8TDY2	1594 aa		37.29	■■■■□ 3.56
SPEG-225	ENST00000617028	NACAD	O15069	1562 aa		37.23	■■■■□ 3.55
SPEG-225	ENST00000617028	DCAF8L2	P0C7V8	631 aa		37.17	■■■■□ 3.54
SPEG-225	ENST00000617028	ZCCHC6	Q5VYS8	1495 aa	Known RBP	37.05	■■■■□ 3.52
SPEG-225	ENST00000617028	MYO15B	Q96JP2	1530 aa		36.98	■■■■□ 3.51
SPEG-225	ENST00000617028	DCAF1	Q9Y4B6	1507 aa		36.82	■■■■□ 3.48
SPEG-225	ENST00000617028	UNC13A	Q9UPW8	1703 aa		36.45	■■■■□ 3.43
SPEG-225	ENST00000617028	PABPN1	Q86U42	306 aa	Known RBP eCLIP	36.15	■■■■□ 3.38
SPEG-225	ENST00000617028	SCRIB	Q14160	1630 aa		36.12	■■■■□ 3.37
SPEG-225	ENST00000617028	BICRA	Q9NZM4	1560 aa		36.11	■■■■□ 3.37
SPEG-225	ENST00000617028	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		35.79	■■■■□ 3.32
SPEG-225	ENST00000617028	DNAJC5B	Q9UF47	199 aa		35.48	■■■■□ 3.27
SPEG-225	ENST00000617028	EIF4G1	Q04637	1599 aa	Known RBP	35.18	■■■■□ 3.22
SPEG-225	ENST00000617028	CC2D2A	Q9P2K1	1620 aa		35.05	■■■■□ 3.2
SPEG-225	ENST00000617028	CECR2	Q9BXF3	1484 aa		34.81	■■■■□ 3.16
SPEG-225	ENST00000617028	SMARCA4	P51532	1647 aa		34.55	■■■■□ 3.12
SPEG-225	ENST00000617028	BAZ1A	Q9NRL2	1556 aa	Predicted RBP	34.51	■■■■□ 3.12
SPEG-225	ENST00000617028	SMARCA2	P51531	1590 aa		34.34	■■■■□ 3.09
SPEG-225	ENST00000617028	ATAD2B	Q9ULI0	1458 aa		34.33	■■■■□ 3.09
SPEG-225	ENST00000617028	NCAPD3	P42695	1498 aa		34.31	■■■■□ 3.08
SPEG-225	ENST00000617028	MROH2B	Q7Z745	1585 aa		34.27	■■■■□ 3.08
SPEG-225	ENST00000617028	PEG3	Q9GZU2	1588 aa		34.19	■■■■□ 3.06
SPEG-225	ENST00000617028	HMGXB3	Q12766	1538 aa		34.18	■■■■□ 3.06
SPEG-225	ENST00000617028	BAZ1B	Q9UIG0	1483 aa	Known RBP	34.08	■■■■□ 3.05
SPEG-225	ENST00000617028	WIZ	O95785	1651 aa		33.93	■■■■□ 3.02
SPEG-225	ENST00000617028	RSF1	Q96T23	1441 aa	Predicted RBP	33.86	■■■■□ 3.01
SPEG-225	ENST00000617028	TOP2A	P11388	1531 aa	Known RBP	33.58	■■■□□ 2.97
SPEG-225	ENST00000617028	NES	P48681	1621 aa		33.49	■■■□□ 2.95
SPEG-225	ENST00000617028	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		33.46	■■■□□ 2.95
SPEG-225	ENST00000617028	ERCC6	Q03468	1493 aa		33.43	■■■□□ 2.94
SPEG-225	ENST00000617028	CADPS	Q9ULU8	1353 aa		33.32	■■■□□ 2.92
SPEG-225	ENST00000617028	PDS5B	Q9NTI5	1447 aa		33.22	■■■□□ 2.91
SPEG-225	ENST00000617028	KIF21A	Q7Z4S6	1674 aa		33.16	■■■□□ 2.9
SPEG-225	ENST00000617028	CCDC88B	A6NC98	1476 aa		33.14	■■■□□ 2.9
SPEG-225	ENST00000617028	CFTR	P13569	1480 aa		33.12	■■■□□ 2.89
SPEG-225	ENST00000617028	DNAJC5	Q9H3Z4	198 aa		33.08	■■■□□ 2.89
SPEG-225	ENST00000617028	CUX2	O14529	1486 aa		33.07	■■■□□ 2.88
SPEG-225	ENST00000617028	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	33.03	■■■□□ 2.88
SPEG-225	ENST00000617028	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	33	■■■□□ 2.87
SPEG-225	ENST00000617028	PRDM2	Q13029	1718 aa		32.97	■■■□□ 2.87
SPEG-225	ENST00000617028	FANCD2	Q9BXW9	1451 aa		32.95	■■■□□ 2.87
SPEG-225	ENST00000617028	CEP164	Q9UPV0	1460 aa		32.93	■■■□□ 2.86
SPEG-225	ENST00000617028	MRC2	Q9UBG0	1479 aa		32.88	■■■□□ 2.85
SPEG-225	ENST00000617028	WDR62	O43379	1518 aa		32.77	■■■□□ 2.84
SPEG-225	ENST00000617028	URB2	Q14146	1524 aa	Known RBP	32.61	■■■□□ 2.81
SPEG-225	ENST00000617028	ABCC8	Q09428	1581 aa		32.45	■■■□□ 2.79
SPEG-225	ENST00000617028	TOPBP1	Q92547	1522 aa		32.42	■■■□□ 2.78
SPEG-225	ENST00000617028	DNMBP	Q6XZF7	1577 aa		32.41	■■■□□ 2.78
SPEG-225	ENST00000617028	IFT140	Q96RY7	1462 aa		32.24	■■■□□ 2.75
SPEG-225	ENST00000617028	CUX1	P39880	1505 aa		32.16	■■■□□ 2.74
SPEG-225	ENST00000617028	POLA1	P09884	1462 aa	Predicted RBP	32.14	■■■□□ 2.74
SPEG-225	ENST00000617028	TARBP1	Q13395	1621 aa	Known RBP	32.08	■■■□□ 2.73
SPEG-225	ENST00000617028	FGD5	Q6ZNL6	1462 aa		32.06	■■■□□ 2.72
SPEG-225	ENST00000617028	ZNF608	Q9ULD9	1512 aa	Predicted RBP	32.05	■■■□□ 2.72
SPEG-225	ENST00000617028	SOGA1	O94964	1423 aa		32	■■■□□ 2.71
SPEG-225	ENST00000617028	RAD54L2	Q9Y4B4	1467 aa		31.98	■■■□□ 2.71
SPEG-225	ENST00000617028	EIF4G3	O43432	1585 aa	Known RBP	31.98	■■■□□ 2.71
SPEG-225	ENST00000617028	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	31.95	■■■□□ 2.71
SPEG-225	ENST00000617028	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		31.92	■■■□□ 2.7
SPEG-225	ENST00000617028	TOP2B	Q02880	1626 aa		31.91	■■■□□ 2.7
SPEG-225	ENST00000617028	SYNJ1	O43426	1573 aa		31.88	■■■□□ 2.69
SPEG-225	ENST00000617028	WDR97	A6NE52	1622 aa		31.87	■■■□□ 2.69
SPEG-225	ENST00000617028	AQR	O60306	1485 aa	Known RBP eCLIP	31.87	■■■□□ 2.69
SPEG-225	ENST00000617028	TDRD9	Q8NDG6	1382 aa	Known RBP	31.81	■■■□□ 2.68
SPEG-225	ENST00000617028	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		31.75	■■■□□ 2.67
SPEG-225	ENST00000617028	OSCAR	Q8IYS5	282 aa		31.67	■■■□□ 2.66
SPEG-225	ENST00000617028	GRIN2B	Q13224	1484 aa		31.65	■■■□□ 2.66
SPEG-225	ENST00000617028	GAPVD1	Q14C86	1478 aa		31.65	■■■□□ 2.66
SPEG-225	ENST00000617028	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		31.64	■■■□□ 2.66
SPEG-225	ENST00000617028	PBRM1	Q86U86	1689 aa		31.64	■■■□□ 2.65
SPEG-225	ENST00000617028	SNAPC4	Q5SXM2	1469 aa		31.61	■■■□□ 2.65
SPEG-225	ENST00000617028	CHD1	O14646	1710 aa		31.6	■■■□□ 2.65
SPEG-225	ENST00000617028	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	31.59	■■■□□ 2.65
SPEG-225	ENST00000617028	FBLN2	P98095	1184 aa		31.53	■■■□□ 2.64
SPEG-225	ENST00000617028	SYNJ2	O15056	1496 aa		31.46	■■■□□ 2.63
SPEG-225	ENST00000617028	CHMP7	Q8WUX9	453 aa	Predicted RBP	31.44	■■■□□ 2.62
SPEG-225	ENST00000617028	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		31.39	■■■□□ 2.62
SPEG-225	ENST00000617028	ADAMTS12	P58397	1594 aa		31.35	■■■□□ 2.61
SPEG-225	ENST00000617028	KIF27	Q86VH2	1401 aa		31.31	■■■□□ 2.6
SPEG-225	ENST00000617028	TRIM41	Q8WV44	630 aa		31.3	■■■□□ 2.6
SPEG-225	ENST00000617028	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		31.28	■■■□□ 2.6
SPEG-225	ENST00000617028	GRIN2A	Q12879	1464 aa		31.24	■■■□□ 2.59
SPEG-225	ENST00000617028	CLASP1	Q7Z460	1538 aa		31.22	■■■□□ 2.59
SPEG-225	ENST00000617028	RIMBP3C	A6NJZ7	1639 aa		31.19	■■■□□ 2.58
SPEG-225	ENST00000617028	RIMBP3B	A6NNM3	1639 aa		31.19	■■■□□ 2.58
SPEG-225	ENST00000617028	RIMBP3	Q9UFD9	1639 aa		31.19	■■■□□ 2.58
SPEG-225	ENST00000617028	ARHGEF11	O15085	1522 aa		31.17	■■■□□ 2.58
SPEG-225	ENST00000617028	CUL7	Q14999	1698 aa		31.14	■■■□□ 2.58
SPEG-225	ENST00000617028	IGF1R	P08069	1367 aa		31.13	■■■□□ 2.57
SPEG-225	ENST00000617028	CEP170	Q5SW79	1584 aa		31.09	■■■□□ 2.57
SPEG-225	ENST00000617028	NUP160	Q12769	1436 aa		31.08	■■■□□ 2.57
SPEG-225	ENST00000617028	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		30.97	■■■□□ 2.55
SPEG-225	ENST00000617028	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		30.95	■■■□□ 2.55
SPEG-225	ENST00000617028	ARAP1	Q96P48	1450 aa		30.9	■■■□□ 2.54
SPEG-225	ENST00000617028	SHROOM2	Q13796	1616 aa		30.88	■■■□□ 2.53
SPEG-225	ENST00000617028	CYB5RL	Q6IPT4	315 aa		30.86	■■■□□ 2.53
SPEG-225	ENST00000617028	RAPGEF2	Q9Y4G8	1499 aa		30.81	■■■□□ 2.52

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