Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCDC78A2IDD5 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CCDC78A2IDD5 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms