RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000221399.7

TULP2-201, Transcript of tubby like protein 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TULP2, Length 1,754 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP2-201ENST00000221399 NISCHQ9Y2I1 1504 aa39.35■■■■□ 3.89
TULP2-201ENST00000221399 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa34.65■■■■□ 3.14
TULP2-201ENST00000221399 ABCC9O60706 1549 aa33.36■■■□□ 2.93
TULP2-201ENST00000221399 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP32.94■■■□□ 2.86
TULP2-201ENST00000221399 DCAF8L2P0C7V8 631 aa32.67■■■□□ 2.82
TULP2-201ENST00000221399 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa32.51■■■□□ 2.8
TULP2-201ENST00000221399 NACADO15069 1562 aa32.39■■■□□ 2.78
TULP2-201ENST00000221399 MYO15BQ96JP2 1530 aa32.36■■■□□ 2.77
TULP2-201ENST00000221399 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.28■■■□□ 2.76
TULP2-201ENST00000221399 SCRIBQ14160 1630 aa31.79■■■□□ 2.68
TULP2-201ENST00000221399 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.7■■■□□ 2.66
TULP2-201ENST00000221399 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa31.65■■■□□ 2.66
TULP2-201ENST00000221399 BICRAQ9NZM4 1560 aa31.37■■■□□ 2.61
TULP2-201ENST00000221399 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.3■■■□□ 2.6
TULP2-201ENST00000221399 CECR2Q9BXF3 1484 aa30.66■■■□□ 2.5
TULP2-201ENST00000221399 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.46■■■□□ 2.47
TULP2-201ENST00000221399 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP30.43■■■□□ 2.46
TULP2-201ENST00000221399 SMARCA4P51532 1647 aa30.42■■■□□ 2.46
TULP2-201ENST00000221399 MROH2BQ7Z745 1585 aa30.41■■■□□ 2.46
TULP2-201ENST00000221399 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP30.26■■■□□ 2.44
TULP2-201ENST00000221399 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.18■■■□□ 2.42
TULP2-201ENST00000221399 WIZO95785 1651 aa30.14■■■□□ 2.42
TULP2-201ENST00000221399 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
TULP2-201ENST00000221399 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa30.06■■■□□ 2.4
TULP2-201ENST00000221399 PEG3Q9GZU2 1588 aa30.05■■■□□ 2.4
TULP2-201ENST00000221399 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.03■■■□□ 2.4
TULP2-201ENST00000221399 SMARCA2P51531 1590 aa30.01■■■□□ 2.39
TULP2-201ENST00000221399 NCAPD3P42695 1498 aa29.89■■■□□ 2.38
TULP2-201ENST00000221399 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
TULP2-201ENST00000221399 HMGXB3Q12766 1538 aa29.82■■■□□ 2.36
TULP2-201ENST00000221399 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
TULP2-201ENST00000221399 CCDC88BA6NC98 1476 aa29.45■■■□□ 2.3
TULP2-201ENST00000221399 NESP48681 1621 aa29.1■■■□□ 2.25
TULP2-201ENST00000221399 CADPSQ9ULU8 1353 aa29.07■■■□□ 2.24
TULP2-201ENST00000221399 CFTRP13569 1480 aa29.05■■■□□ 2.24
TULP2-201ENST00000221399 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa29■■■□□ 2.23
TULP2-201ENST00000221399 PRDM2Q13029 1718 aa28.92■■■□□ 2.22
TULP2-201ENST00000221399 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.77■■■□□ 2.2
TULP2-201ENST00000221399 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.77■■■□□ 2.2
TULP2-201ENST00000221399 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.75■■■□□ 2.19
TULP2-201ENST00000221399 ABCC8Q09428 1581 aa28.66■■■□□ 2.18
TULP2-201ENST00000221399 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.66■■■□□ 2.18
TULP2-201ENST00000221399 ERCC6Q03468 1493 aa28.64■■■□□ 2.18
TULP2-201ENST00000221399 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP28.5■■■□□ 2.15
TULP2-201ENST00000221399 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP28.48■■■□□ 2.15
TULP2-201ENST00000221399 CUX1P39880 1505 aa28.47■■■□□ 2.15
TULP2-201ENST00000221399 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.47■■■□□ 2.15
TULP2-201ENST00000221399 SYNJ1O43426 1573 aa28.46■■■□□ 2.15
TULP2-201ENST00000221399 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.46■■■□□ 2.15
TULP2-201ENST00000221399 CHIC1Q5VXU3 224 aa28.44■■■□□ 2.14
TULP2-201ENST00000221399 DNMBPQ6XZF7 1577 aa28.41■■■□□ 2.14
TULP2-201ENST00000221399 TOPBP1Q92547 1522 aa28.4■■■□□ 2.14
TULP2-201ENST00000221399 TOP2BQ02880 1626 aa28.37■■■□□ 2.13
TULP2-201ENST00000221399 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa28.37■■■□□ 2.13
TULP2-201ENST00000221399 WDR62O43379 1518 aa28.36■■■□□ 2.13
TULP2-201ENST00000221399 TRIM41Q8WV44 630 aa28.29■■■□□ 2.12
TULP2-201ENST00000221399 FGD5Q6ZNL6 1462 aa28.26■■■□□ 2.11
TULP2-201ENST00000221399 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP28.21■■■□□ 2.11
TULP2-201ENST00000221399 CUX2O14529 1486 aa28.13■■■□□ 2.09
TULP2-201ENST00000221399 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa28.13■■■□□ 2.09
TULP2-201ENST00000221399 SOGA1O94964 1423 aa28.07■■■□□ 2.08
TULP2-201ENST00000221399 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
TULP2-201ENST00000221399 WDR97A6NE52 1622 aa28.01■■■□□ 2.07
TULP2-201ENST00000221399 IFT140Q96RY7 1462 aa28■■■□□ 2.07
TULP2-201ENST00000221399 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.97■■■□□ 2.07
TULP2-201ENST00000221399 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
TULP2-201ENST00000221399 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa27.91■■■□□ 2.06
TULP2-201ENST00000221399 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.89■■■□□ 2.06
TULP2-201ENST00000221399 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa27.84■■■□□ 2.05
TULP2-201ENST00000221399 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP27.84■■■□□ 2.05
TULP2-201ENST00000221399 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
TULP2-201ENST00000221399 KIF27Q86VH2 1401 aa27.82■■■□□ 2.04
TULP2-201ENST00000221399 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
TULP2-201ENST00000221399 GAPVD1Q14C86 1478 aa27.77■■■□□ 2.04
TULP2-201ENST00000221399 PBRM1Q86U86 1689 aa27.73■■■□□ 2.03
TULP2-201ENST00000221399 EEA1Q15075 1411 aa27.69■■■□□ 2.02
TULP2-201ENST00000221399 GRIN2BQ13224 1484 aa27.65■■■□□ 2.02
TULP2-201ENST00000221399 IGF1RP08069 1367 aa27.65■■■□□ 2.02
TULP2-201ENST00000221399 ERICH3Q5RHP9 1530 aa27.63■■■□□ 2.01
TULP2-201ENST00000221399 CSRNP3Q8WYN3 585 aa27.61■■■□□ 2.01
TULP2-201ENST00000221399 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa27.58■■■□□ 2.01
TULP2-201ENST00000221399 CUL7Q14999 1698 aa27.52■■■□□ 2
TULP2-201ENST00000221399 ADAMTS12P58397 1594 aa27.52■■■□□ 2
TULP2-201ENST00000221399 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP27.49■■□□□ 1.99
TULP2-201ENST00000221399 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa27.49■■□□□ 1.99
TULP2-201ENST00000221399 PRXQ9BXM0 1461 aa27.49■■□□□ 1.99
TULP2-201ENST00000221399 EHMT2Q96KQ7 1210 aa27.46■■□□□ 1.99
TULP2-201ENST00000221399 FHAD1B1AJZ9 1412 aa27.44■■□□□ 1.98
TULP2-201ENST00000221399 KIF21BO75037 1637 aa27.43■■□□□ 1.98
TULP2-201ENST00000221399 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa27.41■■□□□ 1.98
TULP2-201ENST00000221399 SYNJ2O15056 1496 aa27.4■■□□□ 1.98
TULP2-201ENST00000221399 CHD1O14646 1710 aa27.36■■□□□ 1.97
TULP2-201ENST00000221399 FBLN2P98095 1184 aa27.35■■□□□ 1.97
TULP2-201ENST00000221399 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa27.33■■□□□ 1.97
TULP2-201ENST00000221399 GRIN2AQ12879 1464 aa27.33■■□□□ 1.97
TULP2-201ENST00000221399 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP27.32■■□□□ 1.96
TULP2-201ENST00000221399 GOLGA3Q08378 1498 aa27.32■■□□□ 1.96
TULP2-201ENST00000221399 CEP170Q5SW79 1584 aa27.21■■□□□ 1.95
TULP2-201ENST00000221399 UBTFP17480 764 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
TULP2-201ENST00000221399 NUP160Q12769 1436 aa27.16■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms