Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5B6

PAXBP1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXBP1Q9Y5B6 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
PAXBP1Q9Y5B6 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms