Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EFNA1P20827 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms