Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RTL3Q8N8U3 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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