Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ZCCHC12Q6PEW1 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms