RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381557.6

TNNT3-203, Transcript of troponin T3, fast skeletal type, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TNNT3, Length 1,019 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT3-203ENST00000381557 NISCHQ9Y2I1 1504 aa42.13■■■■■ 4.33
TNNT3-203ENST00000381557 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa37.69■■■■□ 3.62
TNNT3-203ENST00000381557 ABCC9O60706 1549 aa37.12■■■■□ 3.53
TNNT3-203ENST00000381557 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa35.59■■■■□ 3.29
TNNT3-203ENST00000381557 NACADO15069 1562 aa35.47■■■■□ 3.27
TNNT3-203ENST00000381557 DCAF8L2P0C7V8 631 aa35.29■■■■□ 3.24
TNNT3-203ENST00000381557 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.11■■■■□ 3.21
TNNT3-203ENST00000381557 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.02■■■■□ 3.2
TNNT3-203ENST00000381557 UNC13AQ9UPW8 1703 aa34.92■■■■□ 3.18
TNNT3-203ENST00000381557 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa34.85■■■■□ 3.17
TNNT3-203ENST00000381557 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP34.6■■■■□ 3.13
TNNT3-203ENST00000381557 BICRAQ9NZM4 1560 aa34.55■■■■□ 3.12
TNNT3-203ENST00000381557 DNAJC5BQ9UF47 199 aa34.39■■■■□ 3.1
TNNT3-203ENST00000381557 SCRIBQ14160 1630 aa34.3■■■■□ 3.08
TNNT3-203ENST00000381557 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.09■■■■□ 3.05
TNNT3-203ENST00000381557 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP33.64■■■□□ 2.98
TNNT3-203ENST00000381557 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa33.61■■■□□ 2.97
TNNT3-203ENST00000381557 CECR2Q9BXF3 1484 aa33.38■■■□□ 2.93
TNNT3-203ENST00000381557 SMARCA4P51532 1647 aa32.8■■■□□ 2.84
TNNT3-203ENST00000381557 NCAPD3P42695 1498 aa32.7■■■□□ 2.83
TNNT3-203ENST00000381557 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP32.68■■■□□ 2.82
TNNT3-203ENST00000381557 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa32.66■■■□□ 2.82
TNNT3-203ENST00000381557 SMARCA2P51531 1590 aa32.62■■■□□ 2.81
TNNT3-203ENST00000381557 HMGXB3Q12766 1538 aa32.52■■■□□ 2.8
TNNT3-203ENST00000381557 PEG3Q9GZU2 1588 aa32.48■■■□□ 2.79
TNNT3-203ENST00000381557 MROH2BQ7Z745 1585 aa32.47■■■□□ 2.79
TNNT3-203ENST00000381557 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP32.37■■■□□ 2.77
TNNT3-203ENST00000381557 WIZO95785 1651 aa32.15■■■□□ 2.74
TNNT3-203ENST00000381557 NESP48681 1621 aa32.04■■■□□ 2.72
TNNT3-203ENST00000381557 ERCC6Q03468 1493 aa32■■■□□ 2.71
TNNT3-203ENST00000381557 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa31.94■■■□□ 2.7
TNNT3-203ENST00000381557 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP31.93■■■□□ 2.7
TNNT3-203ENST00000381557 CUX2O14529 1486 aa31.81■■■□□ 2.68
TNNT3-203ENST00000381557 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP31.74■■■□□ 2.67
TNNT3-203ENST00000381557 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa31.73■■■□□ 2.67
TNNT3-203ENST00000381557 CADPSQ9ULU8 1353 aa31.7■■■□□ 2.67
TNNT3-203ENST00000381557 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP31.67■■■□□ 2.66
TNNT3-203ENST00000381557 PDS5BQ9NTI5 1447 aa31.66■■■□□ 2.66
TNNT3-203ENST00000381557 CFTRP13569 1480 aa31.46■■■□□ 2.63
TNNT3-203ENST00000381557 MRC2Q9UBG0 1479 aa31.38■■■□□ 2.61
TNNT3-203ENST00000381557 CEP164Q9UPV0 1460 aa31.36■■■□□ 2.61
TNNT3-203ENST00000381557 PRDM2Q13029 1718 aa31.35■■■□□ 2.61
TNNT3-203ENST00000381557 CCDC88BA6NC98 1476 aa31.35■■■□□ 2.61
TNNT3-203ENST00000381557 FANCD2Q9BXW9 1451 aa31.35■■■□□ 2.61
TNNT3-203ENST00000381557 WDR62O43379 1518 aa31.32■■■□□ 2.6
TNNT3-203ENST00000381557 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa31.23■■■□□ 2.59
TNNT3-203ENST00000381557 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP31.08■■■□□ 2.57
TNNT3-203ENST00000381557 TOPBP1Q92547 1522 aa30.83■■■□□ 2.53
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TNNT3-203ENST00000381557 ABCC8Q09428 1581 aa30.81■■■□□ 2.52
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TNNT3-203ENST00000381557 IFT140Q96RY7 1462 aa30.7■■■□□ 2.51
TNNT3-203ENST00000381557 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP30.61■■■□□ 2.49
TNNT3-203ENST00000381557 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP30.57■■■□□ 2.48
TNNT3-203ENST00000381557 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP30.54■■■□□ 2.48
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TNNT3-203ENST00000381557 CUX1P39880 1505 aa30.47■■■□□ 2.47
TNNT3-203ENST00000381557 FGD5Q6ZNL6 1462 aa30.42■■■□□ 2.46
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TNNT3-203ENST00000381557 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.41■■■□□ 2.46
TNNT3-203ENST00000381557 SOGA1O94964 1423 aa30.39■■■□□ 2.46
TNNT3-203ENST00000381557 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP30.38■■■□□ 2.45
TNNT3-203ENST00000381557 WDR97A6NE52 1622 aa30.29■■■□□ 2.44
TNNT3-203ENST00000381557 CHD1O14646 1710 aa30.26■■■□□ 2.43
TNNT3-203ENST00000381557 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP30.26■■■□□ 2.43
TNNT3-203ENST00000381557 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.18■■■□□ 2.42
TNNT3-203ENST00000381557 TOP2BQ02880 1626 aa30.14■■■□□ 2.42
TNNT3-203ENST00000381557 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.12■■■□□ 2.41
TNNT3-203ENST00000381557 SYNJ1O43426 1573 aa30.11■■■□□ 2.41
TNNT3-203ENST00000381557 PBRM1Q86U86 1689 aa30.11■■■□□ 2.41
TNNT3-203ENST00000381557 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.1■■■□□ 2.41
TNNT3-203ENST00000381557 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.1■■■□□ 2.41
TNNT3-203ENST00000381557 GRIN2BQ13224 1484 aa30.08■■■□□ 2.41
TNNT3-203ENST00000381557 FBLN2P98095 1184 aa30.06■■■□□ 2.4
TNNT3-203ENST00000381557 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.06■■■□□ 2.4
TNNT3-203ENST00000381557 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.05■■■□□ 2.4
TNNT3-203ENST00000381557 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
TNNT3-203ENST00000381557 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa30.04■■■□□ 2.4
TNNT3-203ENST00000381557 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa30.04■■■□□ 2.4
TNNT3-203ENST00000381557 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa30.04■■■□□ 2.4
TNNT3-203ENST00000381557 TRIM41Q8WV44 630 aa30.04■■■□□ 2.4
TNNT3-203ENST00000381557 ARHGEF11O15085 1522 aa29.96■■■□□ 2.39
TNNT3-203ENST00000381557 SYNJ2O15056 1496 aa29.93■■■□□ 2.38
TNNT3-203ENST00000381557 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
TNNT3-203ENST00000381557 CLASP1Q7Z460 1538 aa29.85■■■□□ 2.37
TNNT3-203ENST00000381557 ADAMTS12P58397 1594 aa29.78■■■□□ 2.36
TNNT3-203ENST00000381557 ERICH3Q5RHP9 1530 aa29.75■■■□□ 2.35
TNNT3-203ENST00000381557 GRIN2AQ12879 1464 aa29.71■■■□□ 2.35
TNNT3-203ENST00000381557 ARAP1Q96P48 1450 aa29.68■■■□□ 2.34
TNNT3-203ENST00000381557 FHAD1B1AJZ9 1412 aa29.67■■■□□ 2.34
TNNT3-203ENST00000381557 CYB5RLQ6IPT4 315 aa29.66■■■□□ 2.34
TNNT3-203ENST00000381557 CEP170Q5SW79 1584 aa29.61■■■□□ 2.33
TNNT3-203ENST00000381557 NUP160Q12769 1436 aa29.59■■■□□ 2.33
TNNT3-203ENST00000381557 KIF27Q86VH2 1401 aa29.52■■■□□ 2.32
TNNT3-203ENST00000381557 SHROOM2Q13796 1616 aa29.46■■■□□ 2.31
TNNT3-203ENST00000381557 CUL7Q14999 1698 aa29.44■■■□□ 2.3
TNNT3-203ENST00000381557 IGF1RP08069 1367 aa29.43■■■□□ 2.3
TNNT3-203ENST00000381557 ERCC6L2Q5T890 1561 aa29.42■■■□□ 2.3
TNNT3-203ENST00000381557 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa29.35■■■□□ 2.29
TNNT3-203ENST00000381557 JPH4Q96JJ6 628 aa29.26■■■□□ 2.27
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