RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298818.12

ISCA2-201, Transcript of iron-sulfur cluster assembly 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene ISCA2, Length 851 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISCA2-201ENST00000298818 NISCHQ9Y2I1 1504 aa43.18■■■■■ 4.5
ISCA2-201ENST00000298818 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa38.64■■■■□ 3.78
ISCA2-201ENST00000298818 ABCC9O60706 1549 aa38.38■■■■□ 3.74
ISCA2-201ENST00000298818 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa36.6■■■■□ 3.45
ISCA2-201ENST00000298818 NACADO15069 1562 aa36.42■■■■□ 3.42
ISCA2-201ENST00000298818 DCAF8L2P0C7V8 631 aa36.24■■■■□ 3.39
ISCA2-201ENST00000298818 UNC13AQ9UPW8 1703 aa36.05■■■■□ 3.36
ISCA2-201ENST00000298818 MYO15BQ96JP2 1530 aa35.98■■■■□ 3.35
ISCA2-201ENST00000298818 DNAJC5BQ9UF47 199 aa35.88■■■■□ 3.33
ISCA2-201ENST00000298818 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP35.84■■■■□ 3.33
ISCA2-201ENST00000298818 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP35.77■■■■□ 3.32
ISCA2-201ENST00000298818 BICRAQ9NZM4 1560 aa35.68■■■■□ 3.3
ISCA2-201ENST00000298818 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa35.65■■■■□ 3.3
ISCA2-201ENST00000298818 SCRIBQ14160 1630 aa35.25■■■■□ 3.23
ISCA2-201ENST00000298818 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa34.98■■■■□ 3.19
ISCA2-201ENST00000298818 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa34.73■■■■□ 3.15
ISCA2-201ENST00000298818 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP34.7■■■■□ 3.14
ISCA2-201ENST00000298818 CECR2Q9BXF3 1484 aa34.5■■■■□ 3.11
ISCA2-201ENST00000298818 SMARCA4P51532 1647 aa33.66■■■□□ 2.98
ISCA2-201ENST00000298818 NCAPD3P42695 1498 aa33.63■■■□□ 2.97
ISCA2-201ENST00000298818 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa33.59■■■□□ 2.97
ISCA2-201ENST00000298818 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP33.45■■■□□ 2.95
ISCA2-201ENST00000298818 SMARCA2P51531 1590 aa33.44■■■□□ 2.94
ISCA2-201ENST00000298818 HMGXB3Q12766 1538 aa33.4■■■□□ 2.94
ISCA2-201ENST00000298818 MROH2BQ7Z745 1585 aa33.33■■■□□ 2.93
ISCA2-201ENST00000298818 PEG3Q9GZU2 1588 aa33.32■■■□□ 2.92
ISCA2-201ENST00000298818 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP33.22■■■□□ 2.91
ISCA2-201ENST00000298818 NESP48681 1621 aa33.11■■■□□ 2.89
ISCA2-201ENST00000298818 ERCC6Q03468 1493 aa33■■■□□ 2.87
ISCA2-201ENST00000298818 WIZO95785 1651 aa33■■■□□ 2.87
ISCA2-201ENST00000298818 CUX2O14529 1486 aa32.88■■■□□ 2.85
ISCA2-201ENST00000298818 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa32.83■■■□□ 2.85
ISCA2-201ENST00000298818 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa32.75■■■□□ 2.83
ISCA2-201ENST00000298818 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP32.72■■■□□ 2.83
ISCA2-201ENST00000298818 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP32.68■■■□□ 2.82
ISCA2-201ENST00000298818 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa32.62■■■□□ 2.81
ISCA2-201ENST00000298818 CADPSQ9ULU8 1353 aa32.58■■■□□ 2.81
ISCA2-201ENST00000298818 PDS5BQ9NTI5 1447 aa32.54■■■□□ 2.8
ISCA2-201ENST00000298818 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP32.47■■■□□ 2.79
ISCA2-201ENST00000298818 CFTRP13569 1480 aa32.31■■■□□ 2.76
ISCA2-201ENST00000298818 MRC2Q9UBG0 1479 aa32.3■■■□□ 2.76
ISCA2-201ENST00000298818 WDR62O43379 1518 aa32.27■■■□□ 2.76
ISCA2-201ENST00000298818 FANCD2Q9BXW9 1451 aa32.23■■■□□ 2.75
ISCA2-201ENST00000298818 CEP164Q9UPV0 1460 aa32.22■■■□□ 2.75
ISCA2-201ENST00000298818 CCDC88BA6NC98 1476 aa32.15■■■□□ 2.74
ISCA2-201ENST00000298818 PRDM2Q13029 1718 aa32.14■■■□□ 2.74
ISCA2-201ENST00000298818 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP32.03■■■□□ 2.72
ISCA2-201ENST00000298818 TOPBP1Q92547 1522 aa31.7■■■□□ 2.66
ISCA2-201ENST00000298818 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP31.59■■■□□ 2.65
ISCA2-201ENST00000298818 DNMBPQ6XZF7 1577 aa31.59■■■□□ 2.65
ISCA2-201ENST00000298818 IFT140Q96RY7 1462 aa31.55■■■□□ 2.64
ISCA2-201ENST00000298818 ABCC8Q09428 1581 aa31.53■■■□□ 2.64
ISCA2-201ENST00000298818 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP31.46■■■□□ 2.63
ISCA2-201ENST00000298818 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP31.43■■■□□ 2.62
ISCA2-201ENST00000298818 OSCARQ8IYS5 282 aa31.41■■■□□ 2.62
ISCA2-201ENST00000298818 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP31.38■■■□□ 2.61
ISCA2-201ENST00000298818 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP31.37■■■□□ 2.61
ISCA2-201ENST00000298818 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP31.31■■■□□ 2.6
ISCA2-201ENST00000298818 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa31.3■■■□□ 2.6
ISCA2-201ENST00000298818 CUX1P39880 1505 aa31.29■■■□□ 2.6
ISCA2-201ENST00000298818 TRIM41Q8WV44 630 aa31.26■■■□□ 2.59
ISCA2-201ENST00000298818 FGD5Q6ZNL6 1462 aa31.22■■■□□ 2.59
ISCA2-201ENST00000298818 CHD1O14646 1710 aa31.22■■■□□ 2.59
ISCA2-201ENST00000298818 SOGA1O94964 1423 aa31.2■■■□□ 2.59
ISCA2-201ENST00000298818 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP31.14■■■□□ 2.58
ISCA2-201ENST00000298818 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa31.12■■■□□ 2.57
ISCA2-201ENST00000298818 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa31.12■■■□□ 2.57
ISCA2-201ENST00000298818 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa31.12■■■□□ 2.57
ISCA2-201ENST00000298818 WDR97A6NE52 1622 aa31.09■■■□□ 2.57
ISCA2-201ENST00000298818 ARHGEF11O15085 1522 aa30.99■■■□□ 2.55
ISCA2-201ENST00000298818 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa30.96■■■□□ 2.55
ISCA2-201ENST00000298818 FBLN2P98095 1184 aa30.93■■■□□ 2.54
ISCA2-201ENST00000298818 PBRM1Q86U86 1689 aa30.93■■■□□ 2.54
ISCA2-201ENST00000298818 GRIN2BQ13224 1484 aa30.88■■■□□ 2.53
ISCA2-201ENST00000298818 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa30.87■■■□□ 2.53
ISCA2-201ENST00000298818 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa30.87■■■□□ 2.53
ISCA2-201ENST00000298818 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa30.86■■■□□ 2.53
ISCA2-201ENST00000298818 SYNJ1O43426 1573 aa30.85■■■□□ 2.53
ISCA2-201ENST00000298818 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP30.85■■■□□ 2.53
ISCA2-201ENST00000298818 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.83■■■□□ 2.53
ISCA2-201ENST00000298818 TOP2BQ02880 1626 aa30.83■■■□□ 2.53
ISCA2-201ENST00000298818 CLASP1Q7Z460 1538 aa30.79■■■□□ 2.52
ISCA2-201ENST00000298818 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP30.76■■■□□ 2.51
ISCA2-201ENST00000298818 SYNJ2O15056 1496 aa30.76■■■□□ 2.51
ISCA2-201ENST00000298818 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP30.74■■■□□ 2.51
ISCA2-201ENST00000298818 ARAP1Q96P48 1450 aa30.73■■■□□ 2.51
ISCA2-201ENST00000298818 CYB5RLQ6IPT4 315 aa30.7■■■□□ 2.51
ISCA2-201ENST00000298818 ADAMTS12P58397 1594 aa30.58■■■□□ 2.49
ISCA2-201ENST00000298818 GRIN2AQ12879 1464 aa30.51■■■□□ 2.48
ISCA2-201ENST00000298818 CEP170Q5SW79 1584 aa30.48■■■□□ 2.47
ISCA2-201ENST00000298818 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30.47■■■□□ 2.47
ISCA2-201ENST00000298818 FHAD1B1AJZ9 1412 aa30.42■■■□□ 2.46
ISCA2-201ENST00000298818 NUP160Q12769 1436 aa30.42■■■□□ 2.46
ISCA2-201ENST00000298818 ERCC6L2Q5T890 1561 aa30.41■■■□□ 2.46
ISCA2-201ENST00000298818 SHROOM2Q13796 1616 aa30.33■■■□□ 2.45
ISCA2-201ENST00000298818 TRHP20396 242 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
ISCA2-201ENST00000298818 IGF1RP08069 1367 aa30.17■■■□□ 2.42
ISCA2-201ENST00000298818 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa30.15■■■□□ 2.42
ISCA2-201ENST00000298818 KIF27Q86VH2 1401 aa30.12■■■□□ 2.41
ISCA2-201ENST00000298818 CUL7Q14999 1698 aa30.09■■■□□ 2.41
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