Protein–RNA interactions for Protein: P37235

HPCAL1, Hippocalcin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAL1P37235 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HPCAL1P37235 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HPCAL1P37235 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HPCAL1P37235 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HPCAL1P37235 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HPCAL1P37235 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HPCAL1P37235 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HPCAL1P37235 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPCAL1P37235 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPCAL1P37235 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPCAL1P37235 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPCAL1P37235 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPCAL1P37235 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPCAL1P37235 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HPCAL1P37235 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPCAL1P37235 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPCAL1P37235 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPCAL1P37235 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPCAL1P37235 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPCAL1P37235 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPCAL1P37235 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HPCAL1P37235 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms