Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK6Q00534 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms