Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMARCE1Q969G3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms