Protein–RNA interactions for Protein: P08034

GJB1, Gap junction beta-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB1P08034 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB1P08034 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB1P08034 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB1P08034 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB1P08034 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB1P08034 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB1P08034 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB1P08034 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB1P08034 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB1P08034 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB1P08034 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB1P08034 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB1P08034 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB1P08034 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB1P08034 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB1P08034 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB1P08034 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB1P08034 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
GJB1P08034 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB1P08034 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB1P08034 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB1P08034 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB1P08034 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB1P08034 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB1P08034 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB1P08034 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB1P08034 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB1P08034 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB1P08034 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB1P08034 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB1P08034 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB1P08034 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB1P08034 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB1P08034 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB1P08034 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB1P08034 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB1P08034 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB1P08034 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB1P08034 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB1P08034 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB1P08034 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB1P08034 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB1P08034 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB1P08034 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB1P08034 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB1P08034 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB1P08034 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB1P08034 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB1P08034 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB1P08034 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB1P08034 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB1P08034 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB1P08034 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB1P08034 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB1P08034 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB1P08034 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB1P08034 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GJB1P08034 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJB1P08034 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJB1P08034 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJB1P08034 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJB1P08034 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJB1P08034 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GJB1P08034 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJB1P08034 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJB1P08034 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJB1P08034 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJB1P08034 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJB1P08034 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJB1P08034 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GJB1P08034 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJB1P08034 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJB1P08034 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJB1P08034 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJB1P08034 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJB1P08034 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJB1P08034 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJB1P08034 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJB1P08034 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GJB1P08034 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
GJB1P08034 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJB1P08034 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJB1P08034 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GJB1P08034 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GJB1P08034 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GJB1P08034 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJB1P08034 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJB1P08034 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJB1P08034 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJB1P08034 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJB1P08034 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJB1P08034 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJB1P08034 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJB1P08034 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJB1P08034 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJB1P08034 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GJB1P08034 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJB1P08034 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GJB1P08034 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GJB1P08034 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms