Protein–RNA interactions for Protein: Q9H257

CARD9, Caspase recruitment domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARD9Q9H257 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CARD9Q9H257 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CARD9Q9H257 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CARD9Q9H257 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARD9Q9H257 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms