Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
FANCD2Q9BXW9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
FANCD2Q9BXW9 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
FANCD2Q9BXW9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
FANCD2Q9BXW9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
FANCD2Q9BXW9 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
FANCD2Q9BXW9 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC41.65■■■■■ 4.26
FANCD2Q9BXW9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
FANCD2Q9BXW9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
FANCD2Q9BXW9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.64■■■■■ 4.26
FANCD2Q9BXW9 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
FANCD2Q9BXW9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC41.64■■■■■ 4.26
FANCD2Q9BXW9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC41.64■■■■■ 4.26
FANCD2Q9BXW9 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC41.63■■■■■ 4.25
FANCD2Q9BXW9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
FANCD2Q9BXW9 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC41.62■■■■■ 4.25
FANCD2Q9BXW9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
FANCD2Q9BXW9 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
FANCD2Q9BXW9 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC41.62■■■■■ 4.25
FANCD2Q9BXW9 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
FANCD2Q9BXW9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
FANCD2Q9BXW9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC41.61■■■■■ 4.25
FANCD2Q9BXW9 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
FANCD2Q9BXW9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC41.61■■■■■ 4.25
FANCD2Q9BXW9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
FANCD2Q9BXW9 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC41.6■■■■■ 4.25
FANCD2Q9BXW9 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC41.6■■■■■ 4.25
FANCD2Q9BXW9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.6■■■■■ 4.25
FANCD2Q9BXW9 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC41.6■■■■■ 4.25
FANCD2Q9BXW9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC41.6■■■■■ 4.25
FANCD2Q9BXW9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
FANCD2Q9BXW9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
FANCD2Q9BXW9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC41.59■■■■■ 4.25
FANCD2Q9BXW9 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC41.58■■■■■ 4.25
FANCD2Q9BXW9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
FANCD2Q9BXW9 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
FANCD2Q9BXW9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC41.57■■■■■ 4.25
FANCD2Q9BXW9 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC41.56■■■■■ 4.24
FANCD2Q9BXW9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC41.56■■■■■ 4.24
FANCD2Q9BXW9 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
FANCD2Q9BXW9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC41.55■■■■■ 4.24
FANCD2Q9BXW9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
FANCD2Q9BXW9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC41.54■■■■■ 4.24
FANCD2Q9BXW9 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.54■■■■■ 4.24
FANCD2Q9BXW9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC41.54■■■■■ 4.24
FANCD2Q9BXW9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC41.53■■■■■ 4.24
FANCD2Q9BXW9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
FANCD2Q9BXW9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
FANCD2Q9BXW9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC41.53■■■■■ 4.24
FANCD2Q9BXW9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC41.53■■■■■ 4.24
FANCD2Q9BXW9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.52■■■■■ 4.24
FANCD2Q9BXW9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
FANCD2Q9BXW9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
FANCD2Q9BXW9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
FANCD2Q9BXW9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC41.52■■■■■ 4.24
FANCD2Q9BXW9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC41.52■■■■■ 4.24
FANCD2Q9BXW9 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC41.52■■■■■ 4.24
FANCD2Q9BXW9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
FANCD2Q9BXW9 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.51■■■■■ 4.24
FANCD2Q9BXW9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
FANCD2Q9BXW9 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.24
FANCD2Q9BXW9 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC41.51■■■■■ 4.24
FANCD2Q9BXW9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
FANCD2Q9BXW9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
FANCD2Q9BXW9 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC41.49■■■■■ 4.23
FANCD2Q9BXW9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC41.49■■■■■ 4.23
FANCD2Q9BXW9 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
FANCD2Q9BXW9 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC41.48■■■■■ 4.23
FANCD2Q9BXW9 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC41.48■■■■■ 4.23
FANCD2Q9BXW9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
FANCD2Q9BXW9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC41.48■■■■■ 4.23
FANCD2Q9BXW9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.48■■■■■ 4.23
FANCD2Q9BXW9 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
FANCD2Q9BXW9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC41.47■■■■■ 4.23
FANCD2Q9BXW9 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
FANCD2Q9BXW9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
FANCD2Q9BXW9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
FANCD2Q9BXW9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.47■■■■■ 4.23
FANCD2Q9BXW9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.46■■■■■ 4.23
FANCD2Q9BXW9 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC41.46■■■■■ 4.23
FANCD2Q9BXW9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
FANCD2Q9BXW9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
FANCD2Q9BXW9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
FANCD2Q9BXW9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC41.45■■■■■ 4.23
FANCD2Q9BXW9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
FANCD2Q9BXW9 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
FANCD2Q9BXW9 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
FANCD2Q9BXW9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC41.44■■■■■ 4.22
FANCD2Q9BXW9 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
FANCD2Q9BXW9 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC41.43■■■■■ 4.22
FANCD2Q9BXW9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
FANCD2Q9BXW9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC41.43■■■■■ 4.22
FANCD2Q9BXW9 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC41.43■■■■■ 4.22
FANCD2Q9BXW9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
FANCD2Q9BXW9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
FANCD2Q9BXW9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC41.42■■■■■ 4.22
FANCD2Q9BXW9 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
FANCD2Q9BXW9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC41.41■■■■■ 4.22
FANCD2Q9BXW9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC41.41■■■■■ 4.22
FANCD2Q9BXW9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms