Protein–RNA interactions for Protein: Q96AE7

TTC17, Tetratricopeptide repeat protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC17Q96AE7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC17Q96AE7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC17Q96AE7 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC17Q96AE7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC17Q96AE7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TTC17Q96AE7 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC17Q96AE7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TTC17Q96AE7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC17Q96AE7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC17Q96AE7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC17Q96AE7 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TTC17Q96AE7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC17Q96AE7 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC17Q96AE7 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC17Q96AE7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TTC17Q96AE7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC17Q96AE7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC17Q96AE7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC17Q96AE7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC17Q96AE7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC17Q96AE7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC17Q96AE7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC17Q96AE7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC17Q96AE7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC17Q96AE7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC17Q96AE7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC17Q96AE7 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC17Q96AE7 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC17Q96AE7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TTC17Q96AE7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC17Q96AE7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC17Q96AE7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC17Q96AE7 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC17Q96AE7 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC17Q96AE7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC17Q96AE7 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC17Q96AE7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TTC17Q96AE7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TTC17Q96AE7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC17Q96AE7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC17Q96AE7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC17Q96AE7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC17Q96AE7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC17Q96AE7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC17Q96AE7 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC17Q96AE7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TTC17Q96AE7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC17Q96AE7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC17Q96AE7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC17Q96AE7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TTC17Q96AE7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 196.8 ms