Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GTF3AQ92664 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GTF3AQ92664 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 778 ms