Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZQ1

WDFY3, WD repeat and FYVE domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDFY3Q8IZQ1 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
WDFY3Q8IZQ1 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
WDFY3Q8IZQ1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
WDFY3Q8IZQ1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
WDFY3Q8IZQ1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
WDFY3Q8IZQ1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDFY3Q8IZQ1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDFY3Q8IZQ1 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDFY3Q8IZQ1 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDFY3Q8IZQ1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
WDFY3Q8IZQ1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
WDFY3Q8IZQ1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDFY3Q8IZQ1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDFY3Q8IZQ1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDFY3Q8IZQ1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDFY3Q8IZQ1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDFY3Q8IZQ1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
WDFY3Q8IZQ1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDFY3Q8IZQ1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDFY3Q8IZQ1 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDFY3Q8IZQ1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
WDFY3Q8IZQ1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDFY3Q8IZQ1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDFY3Q8IZQ1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDFY3Q8IZQ1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDFY3Q8IZQ1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
WDFY3Q8IZQ1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
WDFY3Q8IZQ1 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDFY3Q8IZQ1 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDFY3Q8IZQ1 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDFY3Q8IZQ1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDFY3Q8IZQ1 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDFY3Q8IZQ1 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDFY3Q8IZQ1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDFY3Q8IZQ1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDFY3Q8IZQ1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
WDFY3Q8IZQ1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WDFY3Q8IZQ1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
WDFY3Q8IZQ1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
WDFY3Q8IZQ1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
WDFY3Q8IZQ1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
WDFY3Q8IZQ1 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
WDFY3Q8IZQ1 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDFY3Q8IZQ1 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
WDFY3Q8IZQ1 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDFY3Q8IZQ1 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
WDFY3Q8IZQ1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WDFY3Q8IZQ1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
WDFY3Q8IZQ1 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
WDFY3Q8IZQ1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WDFY3Q8IZQ1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
WDFY3Q8IZQ1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
WDFY3Q8IZQ1 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms