Protein–RNA interactions for Protein: Q86WH2

RASSF3, Ras association domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASSF3Q86WH2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RASSF3Q86WH2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RASSF3Q86WH2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RASSF3Q86WH2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RASSF3Q86WH2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RASSF3Q86WH2 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RASSF3Q86WH2 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RASSF3Q86WH2 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RASSF3Q86WH2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RASSF3Q86WH2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RASSF3Q86WH2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RASSF3Q86WH2 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RASSF3Q86WH2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RASSF3Q86WH2 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
RASSF3Q86WH2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RASSF3Q86WH2 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RASSF3Q86WH2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RASSF3Q86WH2 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RASSF3Q86WH2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RASSF3Q86WH2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RASSF3Q86WH2 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RASSF3Q86WH2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RASSF3Q86WH2 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RASSF3Q86WH2 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RASSF3Q86WH2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RASSF3Q86WH2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RASSF3Q86WH2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RASSF3Q86WH2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RASSF3Q86WH2 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RASSF3Q86WH2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RASSF3Q86WH2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RASSF3Q86WH2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
RASSF3Q86WH2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RASSF3Q86WH2 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RASSF3Q86WH2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RASSF3Q86WH2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASSF3Q86WH2 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASSF3Q86WH2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASSF3Q86WH2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
RASSF3Q86WH2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASSF3Q86WH2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RASSF3Q86WH2 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RASSF3Q86WH2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RASSF3Q86WH2 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RASSF3Q86WH2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RASSF3Q86WH2 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RASSF3Q86WH2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RASSF3Q86WH2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RASSF3Q86WH2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RASSF3Q86WH2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RASSF3Q86WH2 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
RASSF3Q86WH2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RASSF3Q86WH2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASSF3Q86WH2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASSF3Q86WH2 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASSF3Q86WH2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASSF3Q86WH2 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASSF3Q86WH2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASSF3Q86WH2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASSF3Q86WH2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RASSF3Q86WH2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RASSF3Q86WH2 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
RASSF3Q86WH2 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms