Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 UROD-221ENST00000636293 1102 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.154e-30■■■■■ 41.3
PABPC4Q13310 UROD-212ENST00000472254 934 ntTSL 214.12□□□□□ -0.154e-30■■■■■ 41.3
PABPC4Q13310 UROD-222ENST00000636836 1173 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.174e-30■■■■■ 41.3
PABPC4Q13310 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.774e-16■■■■■ 41.2
PABPC4Q13310 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.754e-16■■■■■ 41.2
PABPC4Q13310 NFKBIA-203ENST00000554001 1396 ntTSL 517.95■□□□□ 0.464e-16■■■■■ 41.2
PABPC4Q13310 NFKBIA-208ENST00000557140 1400 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.064e-16■■■■■ 41.2
PABPC4Q13310 NFKBIA-204ENST00000555371 690 ntTSL 313.31□□□□□ -0.284e-16■■■■■ 41.2
PABPC4Q13310 DPP7-204ENST00000470766 478 ntTSL 216.73■□□□□ 0.276e-7■■■■■ 41.2
PABPC4Q13310 SMIM1-202ENST00000452264 447 ntTSL 219.91■□□□□ 0.783e-7■■■■■ 41.2
PABPC4Q13310 VSTM4-202ENST00000332853 6392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.114e-6■■■■■ 41.1
PABPC4Q13310 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.522e-8■■■■■ 41
PABPC4Q13310 ASAP3-201ENST00000336689 4050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.232e-8■■■■■ 41
PABPC4Q13310 ASAP3-209ENST00000495646 2552 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.562e-8■■■■■ 41
PABPC4Q13310 MCRIP2-210ENST00000620462 1594 ntTSL 521.92■■□□□ 1.19e-9■■■■■ 41
PABPC4Q13310 MCRIP2-206ENST00000615744 1379 ntTSL 321.76■■□□□ 1.079e-9■■■■■ 41
PABPC4Q13310 MCRIP2-204ENST00000575894 1728 nt20.41■□□□□ 0.869e-9■■■■■ 41
PABPC4Q13310 MCRIP2-209ENST00000619674 2306 ntTSL 219.26■□□□□ 0.679e-9■■■■■ 41
PABPC4Q13310 PPP5C-211ENST00000525507 1300 ntTSL 223.99■■□□□ 1.433e-10■■■■■ 41
PABPC4Q13310 PPP5C-206ENST00000486994 2209 ntTSL 219.82■□□□□ 0.763e-10■■■■■ 41
PABPC4Q13310 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.921e-9■■■■■ 41
PABPC4Q13310 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.921e-9■■■■■ 41
PABPC4Q13310 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.241e-6■■■■■ 40.9
PABPC4Q13310 CHCHD6-206ENST00000513253 690 ntTSL 313.41□□□□□ -0.261e-6■■■■■ 40.9
PABPC4Q13310 C9orf16-204ENST00000492588 1570 ntTSL 520.12■□□□□ 0.814e-29■■■■■ 40.9
PABPC4Q13310 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.54e-29■■■■■ 40.9
PABPC4Q13310 FGF13-201ENST00000305414 1939 ntTSL 1 (best) BASIC7.68□□□□□ -1.182e-6■■■■■ 40.9
PABPC4Q13310 FGF13-202ENST00000315930 19519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.542e-6■■■■■ 40.9
PABPC4Q13310 RPS5-207ENST00000599232 1747 nt19.2■□□□□ 0.668e-28■■■■■ 40.9
PABPC4Q13310 UQCC2-203ENST00000606961 4365 nt13.69□□□□□ -0.221e-10■■■■■ 40.8
PABPC4Q13310 STUB1-209ENST00000567173 743 ntTSL 330.55■■■□□ 2.484e-10■■■■■ 40.8
PABPC4Q13310 STUB1-202ENST00000563505 894 ntTSL 229.25■■■□□ 2.274e-10■■■■■ 40.8
PABPC4Q13310 AKAP1-212ENST00000573326 1580 ntTSL 513.56□□□□□ -0.244e-26■■■■■ 40.8
PABPC4Q13310 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.825e-7■■■■■ 40.7
PABPC4Q13310 ATP5D-206ENST00000591249 405 ntTSL 519.88■□□□□ 0.771e-13■■■■■ 40.7
PABPC4Q13310 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.228e-7■■■■■ 40.7
PABPC4Q13310 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.235e-23■■■■■ 40.6
PABPC4Q13310 CYB561A3-206ENST00000536452 1827 ntTSL 215.07■□□□□ 05e-23■■■■■ 40.6
PABPC4Q13310 CYB561A3-215ENST00000540317 1557 ntTSL 313.74□□□□□ -0.215e-23■■■■■ 40.6
PABPC4Q13310 CYB561A3-201ENST00000294072 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.545e-23■■■■■ 40.6
PABPC4Q13310 CYB561A3-202ENST00000426130 3205 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.555e-23■■■■■ 40.6
PABPC4Q13310 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.082e-7■■■■■ 40.6
PABPC4Q13310 DAXX-203ENST00000414083 2355 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.022e-7■■■■■ 40.6
PABPC4Q13310 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.032e-7■■■■■ 40.6
PABPC4Q13310 DAXX-202ENST00000374542 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.212e-7■■■■■ 40.6
PABPC4Q13310 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.823e-10■■■■■ 40.6
PABPC4Q13310 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.23e-10■■■■■ 40.6
PABPC4Q13310 RPS19-203ENST00000598261 307 ntTSL 314.56□□□□□ -0.084e-43■■■■■ 40.6
PABPC4Q13310 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.066e-80■■■■■ 40.5
PABPC4Q13310 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.056e-80■■■■■ 40.5
PABPC4Q13310 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.286e-80■■■■■ 40.5
PABPC4Q13310 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.888e-9■■■■■ 40.5
PABPC4Q13310 RPSA-208ENST00000487876 572 ntTSL 415.47■□□□□ 0.074e-17■■■■■ 40.5
PABPC4Q13310 RPSA-204ENST00000458478 874 ntTSL 213.77□□□□□ -0.214e-17■■■■■ 40.5
PABPC4Q13310 RPSA-201ENST00000301821 1171 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.384e-17■■■■■ 40.5
PABPC4Q13310 RPSA-206ENST00000477325 596 ntTSL 211.81□□□□□ -0.524e-17■■■■■ 40.5
PABPC4Q13310 RPSA-202ENST00000443003 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.934e-17■■■■■ 40.5
PABPC4Q13310 RPSA-205ENST00000475346 622 ntTSL 1 (best)6.99□□□□□ -1.294e-17■■■■■ 40.5
PABPC4Q13310 TUBB2A-201ENST00000333628 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.094e-9■■■■■ 40.5
PABPC4Q13310 MLST8-221ENST00000565330 1403 ntTSL 220.5■□□□□ 0.879e-10■■■■■ 40.5
PABPC4Q13310 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.979e-8■■■■■ 40.5
PABPC4Q13310 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.78□□□□□ -1.163e-7■■■■■ 40.5
PABPC4Q13310 CD53-205ENST00000497404 917 ntTSL 55.62□□□□□ -1.513e-7■■■■■ 40.5
PABPC4Q13310 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.695e-6■■■■■ 40.4
PABPC4Q13310 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.055e-6■■■■■ 40.4
PABPC4Q13310 RAP1A-202ENST00000369709 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.285e-6■■■■■ 40.4
PABPC4Q13310 COPS2-201ENST00000299259 2036 ntTSL 1 (best) BASIC11.71□□□□□ -0.534e-7■■■■■ 40.4
PABPC4Q13310 COPS2-207ENST00000560240 514 ntTSL 49.39□□□□□ -0.914e-7■■■■■ 40.4
PABPC4Q13310 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.634e-7■■■■■ 40.4
PABPC4Q13310 BCL2L2-PABPN1-202ENST00000556100 655 ntTSL 316■□□□□ 0.158e-17■■■■■ 40.3
PABPC4Q13310 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.098e-17■■■■■ 40.3
PABPC4Q13310 GPATCH4-201ENST00000368232 1972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.561e-7■■■■■ 40.3
PABPC4Q13310 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.52e-6■■■■■ 40.3
PABPC4Q13310 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.472e-6■■■■■ 40.3
PABPC4Q13310 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.022e-6■■■■■ 40.3
PABPC4Q13310 FAM120A-203ENST00000427765 1710 ntTSL 1 (best)21.2■□□□□ 0.981e-10■■■■■ 40.2
PABPC4Q13310 PFKM-201ENST00000312352 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.161e-10■■■■■ 40.2
PABPC4Q13310 PFKM-202ENST00000340802 3176 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.411e-10■■■■■ 40.2
PABPC4Q13310 PFKM-206ENST00000546964 3063 ntTSL 1 (best)12.34□□□□□ -0.431e-10■■■■■ 40.2
PABPC4Q13310 PFKM-225ENST00000551804 2797 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.681e-10■■■■■ 40.2
PABPC4Q13310 PFKM-210ENST00000547587 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.781e-10■■■■■ 40.2
PABPC4Q13310 PFKM-203ENST00000359794 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.831e-10■■■■■ 40.2
PABPC4Q13310 PFKM-209ENST00000547581 3579 ntTSL 29.28□□□□□ -0.921e-10■■■■■ 40.2
PABPC4Q13310 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.715e-7■■■■■ 40.2
PABPC4Q13310 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.145e-7■■■■■ 40.2
PABPC4Q13310 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.125e-7■■■■■ 40.2
PABPC4Q13310 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.095e-7■■■■■ 40.2
PABPC4Q13310 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.085e-7■■■■■ 40.2
PABPC4Q13310 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.035e-7■■■■■ 40.2
PABPC4Q13310 UBE3A-226ENST00000637886 8725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.115e-7■■■■■ 40.2
PABPC4Q13310 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.165e-7■■■■■ 40.2
PABPC4Q13310 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.115e-7■■■■■ 40.2
PABPC4Q13310 CELF1-220ENST00000539455 800 ntTSL 56.46□□□□□ -1.386e-17■■■■■ 40.1
PABPC4Q13310 ROGDI-209ENST00000587843 1362 ntTSL 229.17■■■□□ 2.261e-8■■■■■ 40.1
PABPC4Q13310 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.61e-8■■■■■ 40.1
PABPC4Q13310 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.383e-12■■■■■ 40.1
PABPC4Q13310 ROGDI-207ENST00000587377 1394 ntTSL 521.8■■□□□ 1.081e-8■■■■■ 40.1
PABPC4Q13310 ROGDI-213ENST00000591292 2684 ntTSL 220.74■□□□□ 0.911e-8■■■■■ 40.1
PABPC4Q13310 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.853e-12■■■■■ 40.1
PABPC4Q13310 RFC4-202ENST00000392481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.141e-8■■■■■ 40.1
Retrieved 100 of 23,669 protein–RNA pairs in 361.3 ms