Protein–RNA interactions for Protein: Q03518

TAP1, Antigen peptide transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAP1Q03518 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TAP1Q03518 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TAP1Q03518 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TAP1Q03518 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TAP1Q03518 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TAP1Q03518 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TAP1Q03518 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TAP1Q03518 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TAP1Q03518 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
TAP1Q03518 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TAP1Q03518 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
TAP1Q03518 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TAP1Q03518 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAP1Q03518 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAP1Q03518 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAP1Q03518 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAP1Q03518 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TAP1Q03518 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TAP1Q03518 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
TAP1Q03518 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TAP1Q03518 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TAP1Q03518 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TAP1Q03518 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TAP1Q03518 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TAP1Q03518 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAP1Q03518 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAP1Q03518 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAP1Q03518 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAP1Q03518 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TAP1Q03518 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TAP1Q03518 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TAP1Q03518 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TAP1Q03518 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
TAP1Q03518 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAP1Q03518 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAP1Q03518 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAP1Q03518 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAP1Q03518 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAP1Q03518 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAP1Q03518 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAP1Q03518 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
TAP1Q03518 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAP1Q03518 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAP1Q03518 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAP1Q03518 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAP1Q03518 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAP1Q03518 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
TAP1Q03518 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAP1Q03518 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAP1Q03518 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAP1Q03518 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAP1Q03518 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
TAP1Q03518 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAP1Q03518 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAP1Q03518 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAP1Q03518 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAP1Q03518 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
TAP1Q03518 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TAP1Q03518 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TAP1Q03518 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TAP1Q03518 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TAP1Q03518 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TAP1Q03518 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TAP1Q03518 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
TAP1Q03518 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TAP1Q03518 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAP1Q03518 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAP1Q03518 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAP1Q03518 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAP1Q03518 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAP1Q03518 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAP1Q03518 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
TAP1Q03518 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAP1Q03518 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAP1Q03518 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAP1Q03518 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAP1Q03518 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
TAP1Q03518 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TAP1Q03518 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
TAP1Q03518 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TAP1Q03518 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TAP1Q03518 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TAP1Q03518 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
TAP1Q03518 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TAP1Q03518 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
TAP1Q03518 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TAP1Q03518 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TAP1Q03518 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TAP1Q03518 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TAP1Q03518 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TAP1Q03518 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
TAP1Q03518 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TAP1Q03518 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TAP1Q03518 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TAP1Q03518 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TAP1Q03518 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
TAP1Q03518 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TAP1Q03518 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
TAP1Q03518 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TAP1Q03518 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.3 ms