Protein–RNA interactions for Protein: P62333

PSMC6, 26S proteasome regulatory subunit 10B, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC6P62333 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSMC6P62333 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PSMC6P62333 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSMC6P62333 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSMC6P62333 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSMC6P62333 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSMC6P62333 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSMC6P62333 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PSMC6P62333 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PSMC6P62333 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PSMC6P62333 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSMC6P62333 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSMC6P62333 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PSMC6P62333 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSMC6P62333 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSMC6P62333 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSMC6P62333 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PSMC6P62333 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSMC6P62333 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSMC6P62333 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PSMC6P62333 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PSMC6P62333 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSMC6P62333 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSMC6P62333 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSMC6P62333 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSMC6P62333 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PSMC6P62333 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSMC6P62333 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSMC6P62333 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PSMC6P62333 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSMC6P62333 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSMC6P62333 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSMC6P62333 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PSMC6P62333 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSMC6P62333 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSMC6P62333 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSMC6P62333 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSMC6P62333 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSMC6P62333 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PSMC6P62333 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSMC6P62333 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSMC6P62333 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSMC6P62333 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PSMC6P62333 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSMC6P62333 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PSMC6P62333 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSMC6P62333 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PSMC6P62333 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSMC6P62333 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSMC6P62333 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSMC6P62333 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSMC6P62333 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSMC6P62333 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSMC6P62333 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSMC6P62333 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PSMC6P62333 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
PSMC6P62333 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSMC6P62333 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSMC6P62333 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSMC6P62333 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSMC6P62333 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSMC6P62333 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PSMC6P62333 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PSMC6P62333 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSMC6P62333 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSMC6P62333 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSMC6P62333 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSMC6P62333 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSMC6P62333 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSMC6P62333 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PSMC6P62333 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSMC6P62333 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PSMC6P62333 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSMC6P62333 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSMC6P62333 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSMC6P62333 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSMC6P62333 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSMC6P62333 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSMC6P62333 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PSMC6P62333 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSMC6P62333 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSMC6P62333 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSMC6P62333 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSMC6P62333 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSMC6P62333 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSMC6P62333 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSMC6P62333 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSMC6P62333 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PSMC6P62333 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMC6P62333 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMC6P62333 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMC6P62333 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PSMC6P62333 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSMC6P62333 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSMC6P62333 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PSMC6P62333 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMC6P62333 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMC6P62333 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMC6P62333 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PSMC6P62333 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms