Protein–RNA interactions for Protein: P48960

CD97, CD97 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD97P48960 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD97P48960 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD97P48960 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CD97P48960 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD97P48960 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD97P48960 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD97P48960 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD97P48960 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD97P48960 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD97P48960 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CD97P48960 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD97P48960 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD97P48960 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD97P48960 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CD97P48960 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD97P48960 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD97P48960 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD97P48960 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD97P48960 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD97P48960 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD97P48960 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD97P48960 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CD97P48960 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD97P48960 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD97P48960 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD97P48960 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD97P48960 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD97P48960 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD97P48960 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD97P48960 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD97P48960 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CD97P48960 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD97P48960 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CD97P48960 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD97P48960 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD97P48960 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD97P48960 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CD97P48960 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD97P48960 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD97P48960 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD97P48960 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD97P48960 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD97P48960 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD97P48960 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CD97P48960 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD97P48960 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CD97P48960 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CD97P48960 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD97P48960 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD97P48960 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD97P48960 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD97P48960 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD97P48960 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CD97P48960 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD97P48960 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CD97P48960 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD97P48960 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD97P48960 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD97P48960 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD97P48960 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CD97P48960 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CD97P48960 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD97P48960 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD97P48960 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD97P48960 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD97P48960 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD97P48960 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CD97P48960 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD97P48960 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD97P48960 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD97P48960 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CD97P48960 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD97P48960 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD97P48960 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD97P48960 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD97P48960 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CD97P48960 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD97P48960 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CD97P48960 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CD97P48960 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD97P48960 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD97P48960 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CD97P48960 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD97P48960 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CD97P48960 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD97P48960 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD97P48960 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD97P48960 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD97P48960 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD97P48960 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD97P48960 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CD97P48960 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD97P48960 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD97P48960 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD97P48960 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD97P48960 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CD97P48960 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD97P48960 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD97P48960 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CD97P48960 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms