Protein–RNA interactions for Protein: P48960

CD97, CD97 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD97P48960 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
CD97P48960 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
CD97P48960 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC31.12■■■□□ 2.57
CD97P48960 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CD97P48960 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CD97P48960 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
CD97P48960 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
CD97P48960 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
CD97P48960 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CD97P48960 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
CD97P48960 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CD97P48960 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
CD97P48960 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CD97P48960 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CD97P48960 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CD97P48960 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CD97P48960 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CD97P48960 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CD97P48960 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CD97P48960 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
CD97P48960 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CD97P48960 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CD97P48960 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CD97P48960 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CD97P48960 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CD97P48960 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
CD97P48960 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CD97P48960 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CD97P48960 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CD97P48960 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CD97P48960 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CD97P48960 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CD97P48960 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CD97P48960 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CD97P48960 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CD97P48960 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CD97P48960 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CD97P48960 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CD97P48960 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CD97P48960 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CD97P48960 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CD97P48960 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CD97P48960 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CD97P48960 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CD97P48960 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CD97P48960 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
CD97P48960 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CD97P48960 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CD97P48960 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CD97P48960 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CD97P48960 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CD97P48960 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CD97P48960 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CD97P48960 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CD97P48960 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CD97P48960 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CD97P48960 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CD97P48960 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CD97P48960 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CD97P48960 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CD97P48960 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CD97P48960 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CD97P48960 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CD97P48960 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CD97P48960 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CD97P48960 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CD97P48960 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CD97P48960 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CD97P48960 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
CD97P48960 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CD97P48960 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CD97P48960 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CD97P48960 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CD97P48960 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CD97P48960 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CD97P48960 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CD97P48960 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CD97P48960 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CD97P48960 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CD97P48960 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CD97P48960 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CD97P48960 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
CD97P48960 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CD97P48960 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CD97P48960 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
CD97P48960 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
CD97P48960 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CD97P48960 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CD97P48960 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CD97P48960 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CD97P48960 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CD97P48960 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD97P48960 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CD97P48960 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CD97P48960 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CD97P48960 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CD97P48960 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CD97P48960 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD97P48960 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CD97P48960 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms