Protein–RNA interactions for Protein: O95239

KIF4A, Chromosome-associated kinesin KIF4A, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF4AO95239 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KIF4AO95239 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
KIF4AO95239 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
KIF4AO95239 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
KIF4AO95239 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KIF4AO95239 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KIF4AO95239 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
KIF4AO95239 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
KIF4AO95239 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KIF4AO95239 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KIF4AO95239 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
KIF4AO95239 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KIF4AO95239 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
KIF4AO95239 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
KIF4AO95239 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
KIF4AO95239 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KIF4AO95239 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
KIF4AO95239 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
KIF4AO95239 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
KIF4AO95239 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KIF4AO95239 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KIF4AO95239 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
KIF4AO95239 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KIF4AO95239 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KIF4AO95239 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KIF4AO95239 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KIF4AO95239 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
KIF4AO95239 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KIF4AO95239 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KIF4AO95239 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KIF4AO95239 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
KIF4AO95239 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIF4AO95239 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIF4AO95239 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIF4AO95239 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIF4AO95239 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIF4AO95239 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIF4AO95239 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIF4AO95239 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIF4AO95239 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
KIF4AO95239 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KIF4AO95239 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
KIF4AO95239 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KIF4AO95239 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
KIF4AO95239 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KIF4AO95239 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KIF4AO95239 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
KIF4AO95239 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIF4AO95239 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIF4AO95239 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIF4AO95239 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIF4AO95239 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIF4AO95239 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIF4AO95239 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIF4AO95239 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIF4AO95239 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
KIF4AO95239 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KIF4AO95239 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
KIF4AO95239 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
KIF4AO95239 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.08■■□□□ 1.76
KIF4AO95239 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KIF4AO95239 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KIF4AO95239 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KIF4AO95239 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
KIF4AO95239 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
KIF4AO95239 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KIF4AO95239 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
KIF4AO95239 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KIF4AO95239 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KIF4AO95239 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KIF4AO95239 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KIF4AO95239 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
KIF4AO95239 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KIF4AO95239 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KIF4AO95239 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KIF4AO95239 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KIF4AO95239 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KIF4AO95239 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
KIF4AO95239 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KIF4AO95239 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
KIF4AO95239 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KIF4AO95239 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
KIF4AO95239 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KIF4AO95239 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KIF4AO95239 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
KIF4AO95239 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KIF4AO95239 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KIF4AO95239 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KIF4AO95239 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KIF4AO95239 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KIF4AO95239 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
KIF4AO95239 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
KIF4AO95239 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
KIF4AO95239 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KIF4AO95239 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KIF4AO95239 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KIF4AO95239 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
KIF4AO95239 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KIF4AO95239 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
KIF4AO95239 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms