Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
CSPP1Q1MSJ5 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
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