Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
CSPP1Q1MSJ5 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
CSPP1Q1MSJ5 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
CSPP1Q1MSJ5 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC38.16■■■■□ 3.7
CSPP1Q1MSJ5 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CSPP1Q1MSJ5 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CSPP1Q1MSJ5 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
CSPP1Q1MSJ5 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CSPP1Q1MSJ5 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
CSPP1Q1MSJ5 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
CSPP1Q1MSJ5 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.09■■■■□ 3.53
CSPP1Q1MSJ5 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC37.05■■■■□ 3.52
CSPP1Q1MSJ5 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
CSPP1Q1MSJ5 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.81■■■■□ 3.48
CSPP1Q1MSJ5 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.8■■■■□ 3.48
CSPP1Q1MSJ5 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
CSPP1Q1MSJ5 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
CSPP1Q1MSJ5 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
CSPP1Q1MSJ5 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
CSPP1Q1MSJ5 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
CSPP1Q1MSJ5 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
CSPP1Q1MSJ5 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CSPP1Q1MSJ5 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
CSPP1Q1MSJ5 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
CSPP1Q1MSJ5 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
CSPP1Q1MSJ5 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
CSPP1Q1MSJ5 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
CSPP1Q1MSJ5 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CSPP1Q1MSJ5 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CSPP1Q1MSJ5 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
CSPP1Q1MSJ5 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CSPP1Q1MSJ5 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CSPP1Q1MSJ5 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
CSPP1Q1MSJ5 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
CSPP1Q1MSJ5 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CSPP1Q1MSJ5 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.1■■■■□ 3.21
CSPP1Q1MSJ5 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
CSPP1Q1MSJ5 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CSPP1Q1MSJ5 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CSPP1Q1MSJ5 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
CSPP1Q1MSJ5 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CSPP1Q1MSJ5 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
CSPP1Q1MSJ5 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.89■■■■□ 3.18
CSPP1Q1MSJ5 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
CSPP1Q1MSJ5 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.86■■■■□ 3.17
CSPP1Q1MSJ5 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
CSPP1Q1MSJ5 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
CSPP1Q1MSJ5 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
CSPP1Q1MSJ5 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
CSPP1Q1MSJ5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CSPP1Q1MSJ5 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
CSPP1Q1MSJ5 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CSPP1Q1MSJ5 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CSPP1Q1MSJ5 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CSPP1Q1MSJ5 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CSPP1Q1MSJ5 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
CSPP1Q1MSJ5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CSPP1Q1MSJ5 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CSPP1Q1MSJ5 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
CSPP1Q1MSJ5 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
CSPP1Q1MSJ5 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
CSPP1Q1MSJ5 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CSPP1Q1MSJ5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CSPP1Q1MSJ5 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CSPP1Q1MSJ5 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CSPP1Q1MSJ5 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
CSPP1Q1MSJ5 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
CSPP1Q1MSJ5 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CSPP1Q1MSJ5 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
CSPP1Q1MSJ5 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
CSPP1Q1MSJ5 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
CSPP1Q1MSJ5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
CSPP1Q1MSJ5 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
CSPP1Q1MSJ5 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CSPP1Q1MSJ5 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
CSPP1Q1MSJ5 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CSPP1Q1MSJ5 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
CSPP1Q1MSJ5 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CSPP1Q1MSJ5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CSPP1Q1MSJ5 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
CSPP1Q1MSJ5 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
CSPP1Q1MSJ5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CSPP1Q1MSJ5 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
CSPP1Q1MSJ5 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
CSPP1Q1MSJ5 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
CSPP1Q1MSJ5 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CSPP1Q1MSJ5 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
CSPP1Q1MSJ5 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CSPP1Q1MSJ5 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CSPP1Q1MSJ5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CSPP1Q1MSJ5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CSPP1Q1MSJ5 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
CSPP1Q1MSJ5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
CSPP1Q1MSJ5 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
CSPP1Q1MSJ5 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CSPP1Q1MSJ5 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CSPP1Q1MSJ5 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CSPP1Q1MSJ5 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms