Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.43e-8■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 AL049650.1-201ENST00000461548 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.22e-34■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 TOMM20-201ENST00000366607 3387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.427e-7■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.051e-16■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.321e-16■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 RNPS1-206ENST00000562205 2223 ntTSL 217.58■□□□□ 0.43e-8■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.345e-10■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 FBL-205ENST00000595545 896 ntTSL 210.42□□□□□ -0.748e-11■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.585e-10■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.114e-9■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 IMPDH2-211ENST00000491610 844 ntTSL 512.33□□□□□ -0.442e-7■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 IMPDH2-204ENST00000462980 908 ntTSL 211.6□□□□□ -0.552e-7■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.962e-6■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.832e-6■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.752e-6■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 EWSR1-221ENST00000610553 2300 ntTSL 218.6■□□□□ 0.572e-6■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.622e-10■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.627e-9■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 HM13-220ENST00000492709 1248 ntTSL 518.5■□□□□ 0.557e-9■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 HM13-218ENST00000487281 757 ntTSL 318.17■□□□□ 0.57e-9■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.287e-9■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 HM13-211ENST00000468559 675 ntTSL 515.52■□□□□ 0.087e-9■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 HM13-204ENST00000398174 3792 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.497e-9■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 HM13-225ENST00000619859 455 ntTSL 38.22□□□□□ -1.097e-9■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 CTNNA1-236ENST00000522792 2044 ntTSL 217.35■□□□□ 0.372e-8■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 CTNNA1-243ENST00000540387 2684 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.762e-8■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 CTNNA1-210ENST00000518825 3536 ntTSL 1 (best) BASIC9.3□□□□□ -0.922e-8■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 CTNNA1-201ENST00000302763 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.12e-8■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 CTNNA1-244ENST00000627109 3831 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.162e-8■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 CCND3-216ENST00000511686 576 ntTSL 318.32■□□□□ 0.521e-10■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 POLE4-203ENST00000465242 528 ntTSL 26.03□□□□□ -1.441e-7■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.751e-7■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.291e-7■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 CTTN-213ENST00000529736 952 ntTSL 316.67■□□□□ 0.261e-7■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.031e-7■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 RPL19-201ENST00000225430 732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.49e-17■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 RPL19-205ENST00000579374 690 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.49e-17■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.488e-7■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.378e-7■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.078e-7■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 SYNGR2-204ENST00000589168 2125 ntTSL 220.21■□□□□ 0.838e-7■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.768e-7■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 TDRG1-201ENST00000373170 1165 ntTSL 1 (best)18.72■□□□□ 0.592e-7■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 TDRG1-203ENST00000448559 741 ntTSL 214□□□□□ -0.172e-7■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 TDRG1-204ENST00000451810 919 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.662e-7■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 TDRG1-202ENST00000448433 1015 ntTSL 3 BASIC9.1□□□□□ -0.952e-7■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 PKP4-205ENST00000426248 4134 ntTSL 1 (best)17.32■□□□□ 0.365e-7■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 PKP4-201ENST00000389757 5777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.555e-7■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 PKP4-210ENST00000480171 2772 ntTSL 29.46□□□□□ -0.895e-7■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 PKP4-202ENST00000389759 4443 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.4□□□□□ -0.95e-7■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.133e-9■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.413e-9■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.43e-9■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 FAM98C-206ENST00000588348 2530 ntTSL 223■■□□□ 1.273e-9■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 FAM98C-207ENST00000589027 670 ntTSL 218.41■□□□□ 0.543e-9■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 FAM98C-204ENST00000586372 4133 ntTSL 216.91■□□□□ 0.33e-9■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.054e-9■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.554e-9■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 GRAP2-201ENST00000344138 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.52e-7■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.715e-7■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.225e-7■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 TAF9-205ENST00000506736 1331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.84□□□□□ -1.315e-7■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 AK6-205ENST00000618980 483 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.515e-7■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 MCM5-209ENST00000493076 4599 ntTSL 212.36□□□□□ -0.438e-14■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 EEF1D-216ENST00000526710 996 ntTSL 224.66■■□□□ 1.542e-10■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 EEF1D-228ENST00000529832 600 ntTSL 422.56■■□□□ 1.22e-10■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 EEF1D-209ENST00000524900 343 ntTSL 521.14■□□□□ 0.972e-10■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 EEF1D-231ENST00000530306 583 ntTSL 219.04■□□□□ 0.642e-10■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 EEF1D-211ENST00000525261 559 ntTSL 217.87■□□□□ 0.452e-10■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 EEF1D-245ENST00000532596 761 ntTSL 417.87■□□□□ 0.452e-10■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 EEF1D-240ENST00000531770 589 ntTSL 416.93■□□□□ 0.32e-10■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 EEF1D-233ENST00000530545 616 ntTSL 416.68■□□□□ 0.262e-10■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 EEF1D-220ENST00000528303 558 ntTSL 415.9■□□□□ 0.142e-10■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 EEF1D-254ENST00000534475 538 ntTSL 415.14■□□□□ 0.012e-10■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 EEF1D-255ENST00000534804 555 ntTSL 410.16□□□□□ -0.782e-10■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.928e-7■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.558e-7■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.48e-7■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.218e-7■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 RNF167-216ENST00000576965 599 ntTSL 516.05■□□□□ 0.168e-7■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 RNF167-206ENST00000572382 989 ntTSL 215.87■□□□□ 0.138e-7■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 RNF167-207ENST00000572430 1511 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.41□□□□□ -0.18e-7■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 NTMT1-206ENST00000481189 576 ntTSL 221.46■■□□□ 1.037e-9■■□□□ 13.2
PABPC4Q13310 NDUFS8-213ENST00000531282 536 ntTSL 222.57■■□□□ 1.26e-7■■□□□ 13.1
PABPC4Q13310 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.422e-67■■□□□ 13.1
PABPC4Q13310 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.912e-7■■□□□ 13.1
PABPC4Q13310 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.142e-7■■□□□ 13.1
PABPC4Q13310 ARID1A-204ENST00000430799 6521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.473e-11■■□□□ 13.1
PABPC4Q13310 ARID1A-217ENST00000637788 3046 nt11.19□□□□□ -0.623e-11■■□□□ 13.1
PABPC4Q13310 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.334e-10■■□□□ 13.1
PABPC4Q13310 MTA2-202ENST00000524902 2577 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.354e-10■■□□□ 13.1
PABPC4Q13310 HSPA5-201ENST00000324460 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.67e-14■■□□□ 13.1
PABPC4Q13310 RHBDD2-207ENST00000468304 803 ntTSL 215.73■□□□□ 0.117e-6■■□□□ 13.1
PABPC4Q13310 PRELID1-205ENST00000504594 886 ntTSL 321.77■■□□□ 1.084e-9■■□□□ 13.1
PABPC4Q13310 MAP2K2-207ENST00000599021 314 ntTSL 510.08□□□□□ -0.82e-6■■□□□ 13.1
PABPC4Q13310 AC018521.1-202ENST00000641877 2655 ntBASIC13.97□□□□□ -0.177e-7■■□□□ 13.1
PABPC4Q13310 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.721e-16■■□□□ 13.1
PABPC4Q13310 ADIPOR1-205ENST00000495562 2109 ntTSL 210.74□□□□□ -0.691e-16■■□□□ 13.1
PABPC4Q13310 EIF3E-209ENST00000519627 697 ntTSL 26.49□□□□□ -1.374e-10■■□□□ 13.1
PABPC4Q13310 APEX2-201ENST00000374987 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.937e-27■■□□□ 13.1
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