Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2Q9

PRPF8, Pre-mRNA-processing-splicing factor 8, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 2,335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8Q6P2Q9 ARL6IP6-205ENST00000495469 1308 ntTSL 217.92■□□□□ 0.461e-9■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.281e-9■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 ARL6IP6-203ENST00000455875 479 ntTSL 20.5□□□□□ -2.331e-9■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 ARL6IP6-202ENST00000425034 465 ntTSL 20.26□□□□□ -2.371e-9■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.32e-12■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.392e-12■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.392e-12■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.472e-12■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 KDM6A-201ENST00000377967 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.82e-12■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 KDM6A-214ENST00000621147 2876 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.062e-12■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.541e-7■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.541e-7■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.541e-7■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 PPIA-202ENST00000415933 863 ntTSL 28.66□□□□□ -1.021e-7■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 PPIA-205ENST00000479021 552 ntTSL 48.49□□□□□ -1.051e-7■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 PPIA-204ENST00000468812 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.361e-7■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 PPIA-203ENST00000451562 544 ntTSL 2 BASIC6.41□□□□□ -1.381e-7■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 PPP2R5C-231ENST00000557716 645 ntTSL 50.37□□□□□ -2.351e-6■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.81e-19■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 PHLDB1-210ENST00000526826 547 ntTSL 413.17□□□□□ -0.32e-7■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 PHLDB1-219ENST00000531987 991 ntTSL 29.43□□□□□ -0.92e-7■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 FOXP1-213ENST00000493010 544 ntTSL 47.5□□□□□ -1.211e-19■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 SF1-213ENST00000472725 632 ntTSL 316.65■□□□□ 0.268e-11■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 SF1-208ENST00000432725 475 ntTSL 413.06□□□□□ -0.328e-11■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 PUM1-202ENST00000373741 4242 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.835e-7■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 PUM1-201ENST00000257075 5360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.78□□□□□ -15e-7■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 PUM1-204ENST00000373747 5375 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.285e-7■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 PUM1-203ENST00000373742 3515 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.315e-7■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 PUM1-205ENST00000424085 4631 ntTSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.315e-7■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 PUM1-214ENST00000525843 4528 ntTSL 56.6□□□□□ -1.355e-7■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 PUM1-206ENST00000426105 4043 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.45e-7■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 PUM1-207ENST00000440538 3936 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.555e-7■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 MERTK-206ENST00000473065 545 ntTSL 30.36□□□□□ -2.353e-9■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 BECN1-218ENST00000591307 744 ntTSL 215.11■□□□□ 0.013e-8■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 BECN1-219ENST00000593112 557 ntTSL 215.1■□□□□ 0.013e-8■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 BECN1-211ENST00000589636 561 ntTSL 413.12□□□□□ -0.313e-8■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 BECN1-204ENST00000585515 636 ntTSL 23.47□□□□□ -1.853e-8■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 RBM5-225ENST00000494360 585 ntTSL 25.76□□□□□ -1.493e-8■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 GMPR2-227ENST00000560517 719 ntTSL 39.39□□□□□ -0.911e-17■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.262e-24■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 H3F3A-203ENST00000366815 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.882e-24■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 H3F3A-202ENST00000366814 1863 ntTSL 2 BASIC8.59□□□□□ -1.032e-24■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 H3F3A-201ENST00000366813 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.332e-24■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.073e-7■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.473e-7■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.483e-7■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.683e-7■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 CDCA5-205ENST00000524733 835 ntTSL 314.78□□□□□ -0.041e-6■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 CELF1-220ENST00000539455 800 ntTSL 55□□□□□ -1.619e-7■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 TRIM35-204ENST00000521283 619 ntTSL 28.73□□□□□ -1.013e-7■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 ZNF142-202ENST00000432460 813 ntTSL 316.99■□□□□ 0.314e-7■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 ZNF142-206ENST00000450560 373 ntTSL 315.21■□□□□ 0.024e-7■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 DDX42-217ENST00000584010 3929 ntTSL 25.57□□□□□ -1.523e-7■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.567e-21■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16■□□□□ 0.157e-21■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 COMMD3-BMI1-201ENST00000417470 745 ntTSL 514.65□□□□□ -0.061e-7■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 ALDH7A1-223ENST00000636482 1337 ntTSL 59.75□□□□□ -0.852e-6■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 FAAH-205ENST00000493636 527 ntTSL 39.74□□□□□ -0.857e-21■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 ALDH7A1-209ENST00000497231 2255 ntTSL 27.07□□□□□ -1.282e-6■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 COMMD3-BMI1-205ENST00000602390 1419 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.369e-8■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 CPS1-201ENST00000233072 5821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.662e-7■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 CPS1-203ENST00000430249 5698 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.672e-7■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 CPS1-204ENST00000451903 4770 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.722e-7■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 KDM3A-204ENST00000427678 565 ntTSL 212.46□□□□□ -0.419e-7■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 SLC38A2-214ENST00000612232 1221 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.876e-9■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 RPS15A-211ENST00000575669 3828 nt6.4□□□□□ -1.384e-8■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 RPS15A-204ENST00000563579 284 ntTSL 31.92□□□□□ -2.14e-8■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC12.45□□□□□ -0.423e-10■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 PTK2-252ENST00000523803 750 ntTSL 37.21□□□□□ -1.263e-10■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 PTK2-235ENST00000521907 542 ntTSL 46.48□□□□□ -1.373e-10■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 PTK2-222ENST00000520475 570 ntTSL 56.19□□□□□ -1.423e-10■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 CHMP6-204ENST00000572778 737 ntTSL 217.3■□□□□ 0.369e-7■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.039e-7■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 CHMP6-202ENST00000571457 552 ntTSL 310.35□□□□□ -0.759e-7■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 CHMP6-203ENST00000572525 611 ntTSL 39.42□□□□□ -0.99e-7■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 RBL2-204ENST00000561512 838 ntTSL 21.15□□□□□ -2.239e-7■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.411e-6■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.61e-6■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 TBC1D4-205ENST00000478591 759 ntTSL 33.74□□□□□ -1.813e-9■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.626e-7■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.626e-7■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 NUP98-202ENST00000355260 5628 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.566e-7■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 SLC3A2-214ENST00000539507 534 ntTSL 35.88□□□□□ -1.472e-9■■■■■ 28.7
PRPF8Q6P2Q9 C2orf69-202ENST00000491721 1034 ntTSL 219.77■□□□□ 0.761e-11■■■■■ 28.6
PRPF8Q6P2Q9 C2orf69-201ENST00000319974 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.791e-11■■■■■ 28.6
PRPF8Q6P2Q9 CHN2-213ENST00000439384 578 ntTSL 510.38□□□□□ -0.754e-6■■■■■ 28.6
PRPF8Q6P2Q9 CHN2-219ENST00000470261 570 ntTSL 34.89□□□□□ -1.634e-6■■■■■ 28.6
PRPF8Q6P2Q9 NF1-218ENST00000577967 5799 nt3.19□□□□□ -1.94e-6■■■■■ 28.6
PRPF8Q6P2Q9 CHN2-217ENST00000461824 425 ntTSL 52.32□□□□□ -2.044e-6■■■■■ 28.6
PRPF8Q6P2Q9 CSDE1-217ENST00000534699 2667 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.82□□□□□ -17e-7■■■■■ 28.6
PRPF8Q6P2Q9 CSDE1-218ENST00000610726 4312 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.397e-7■■■■■ 28.6
PRPF8Q6P2Q9 CSDE1-204ENST00000369530 3774 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.547e-7■■■■■ 28.6
PRPF8Q6P2Q9 CSDE1-214ENST00000530886 3459 ntTSL 5 BASIC5.44□□□□□ -1.547e-7■■■■■ 28.6
PRPF8Q6P2Q9 CSDE1-201ENST00000261443 3228 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.557e-7■■■■■ 28.6
PRPF8Q6P2Q9 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.567e-7■■■■■ 28.6
PRPF8Q6P2Q9 CSDE1-202ENST00000339438 4006 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.727e-7■■■■■ 28.6
PRPF8Q6P2Q9 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.043e-8■■■■■ 28.6
PRPF8Q6P2Q9 NUB1-211ENST00000497987 861 ntTSL 27.61□□□□□ -1.191e-10■■■■■ 28.6
PRPF8Q6P2Q9 NUB1-206ENST00000477666 568 ntTSL 31.28□□□□□ -2.21e-10■■■■■ 28.6
PRPF8Q6P2Q9 ARHGAP32-207ENST00000533509 1064 ntTSL 1 (best)4.3□□□□□ -1.723e-10■■■■■ 28.6
Retrieved 100 of 73,762 protein–RNA pairs in 1321.8 ms