RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589636.5

BECN1-211, Transcript of beclin 1, humanhuman

TSL 4

Gene BECN1, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1-211ENST00000589636 NISCHQ9Y2I1 1504 aa38.02■■■■□ 3.68
BECN1-211ENST00000589636 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa33.76■■■■□ 3
BECN1-211ENST00000589636 ABCC9O60706 1549 aa33.01■■■□□ 2.87
BECN1-211ENST00000589636 NACADO15069 1562 aa31.78■■■□□ 2.68
BECN1-211ENST00000589636 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa31.76■■■□□ 2.67
BECN1-211ENST00000589636 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.7■■■□□ 2.67
BECN1-211ENST00000589636 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP31.65■■■□□ 2.66
BECN1-211ENST00000589636 DCAF8L2P0C7V8 631 aa31.58■■■□□ 2.65
BECN1-211ENST00000589636 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa31.53■■■□□ 2.64
BECN1-211ENST00000589636 UNC13AQ9UPW8 1703 aa31.08■■■□□ 2.57
BECN1-211ENST00000589636 BICRAQ9NZM4 1560 aa30.92■■■□□ 2.54
BECN1-211ENST00000589636 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP30.86■■■□□ 2.53
BECN1-211ENST00000589636 SCRIBQ14160 1630 aa30.69■■■□□ 2.5
BECN1-211ENST00000589636 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa30.57■■■□□ 2.48
BECN1-211ENST00000589636 DNAJC5BQ9UF47 199 aa30.53■■■□□ 2.48
BECN1-211ENST00000589636 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
BECN1-211ENST00000589636 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa29.9■■■□□ 2.38
BECN1-211ENST00000589636 CECR2Q9BXF3 1484 aa29.68■■■□□ 2.34
BECN1-211ENST00000589636 SMARCA4P51532 1647 aa29.45■■■□□ 2.31
BECN1-211ENST00000589636 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
BECN1-211ENST00000589636 NCAPD3P42695 1498 aa29.41■■■□□ 2.3
BECN1-211ENST00000589636 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa29.36■■■□□ 2.29
BECN1-211ENST00000589636 MROH2BQ7Z745 1585 aa29.29■■■□□ 2.28
BECN1-211ENST00000589636 PEG3Q9GZU2 1588 aa29.27■■■□□ 2.28
BECN1-211ENST00000589636 SMARCA2P51531 1590 aa29.26■■■□□ 2.27
BECN1-211ENST00000589636 HMGXB3Q12766 1538 aa29.17■■■□□ 2.26
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BECN1-211ENST00000589636 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP28.97■■■□□ 2.23
BECN1-211ENST00000589636 WIZO95785 1651 aa28.92■■■□□ 2.22
BECN1-211ENST00000589636 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP28.61■■■□□ 2.17
BECN1-211ENST00000589636 NESP48681 1621 aa28.61■■■□□ 2.17
BECN1-211ENST00000589636 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa28.54■■■□□ 2.16
BECN1-211ENST00000589636 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.5■■■□□ 2.15
BECN1-211ENST00000589636 ERCC6Q03468 1493 aa28.36■■■□□ 2.13
BECN1-211ENST00000589636 CCDC88BA6NC98 1476 aa28.34■■■□□ 2.13
BECN1-211ENST00000589636 CFTRP13569 1480 aa28.34■■■□□ 2.13
BECN1-211ENST00000589636 PDS5BQ9NTI5 1447 aa28.33■■■□□ 2.13
BECN1-211ENST00000589636 CUX2O14529 1486 aa28.21■■■□□ 2.11
BECN1-211ENST00000589636 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa28.21■■■□□ 2.11
BECN1-211ENST00000589636 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP28.18■■■□□ 2.1
BECN1-211ENST00000589636 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.09■■■□□ 2.09
BECN1-211ENST00000589636 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
BECN1-211ENST00000589636 MRC2Q9UBG0 1479 aa28.02■■■□□ 2.08
BECN1-211ENST00000589636 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.02■■■□□ 2.08
BECN1-211ENST00000589636 PRDM2Q13029 1718 aa28■■■□□ 2.07
BECN1-211ENST00000589636 WDR62O43379 1518 aa27.97■■■□□ 2.07
BECN1-211ENST00000589636 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP27.87■■■□□ 2.05
BECN1-211ENST00000589636 ABCC8Q09428 1581 aa27.68■■■□□ 2.02
BECN1-211ENST00000589636 TOPBP1Q92547 1522 aa27.67■■■□□ 2.02
BECN1-211ENST00000589636 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.6■■■□□ 2.01
BECN1-211ENST00000589636 IFT140Q96RY7 1462 aa27.49■■□□□ 1.99
BECN1-211ENST00000589636 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa27.48■■□□□ 1.99
BECN1-211ENST00000589636 CUX1P39880 1505 aa27.46■■□□□ 1.99
BECN1-211ENST00000589636 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP27.44■■□□□ 1.98
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BECN1-211ENST00000589636 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP27.39■■□□□ 1.98
BECN1-211ENST00000589636 FGD5Q6ZNL6 1462 aa27.33■■□□□ 1.97
BECN1-211ENST00000589636 SOGA1O94964 1423 aa27.32■■□□□ 1.96
BECN1-211ENST00000589636 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa27.31■■□□□ 1.96
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BECN1-211ENST00000589636 TOP2BQ02880 1626 aa27.2■■□□□ 1.95
BECN1-211ENST00000589636 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa27.2■■□□□ 1.95
BECN1-211ENST00000589636 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
BECN1-211ENST00000589636 SYNJ1O43426 1573 aa27.18■■□□□ 1.94
BECN1-211ENST00000589636 WDR97A6NE52 1622 aa27.16■■□□□ 1.94
BECN1-211ENST00000589636 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
BECN1-211ENST00000589636 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa27.13■■□□□ 1.93
BECN1-211ENST00000589636 OSCARQ8IYS5 282 aa27.05■■□□□ 1.92
BECN1-211ENST00000589636 GRIN2BQ13224 1484 aa26.99■■□□□ 1.91
BECN1-211ENST00000589636 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa26.98■■□□□ 1.91
BECN1-211ENST00000589636 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.98■■□□□ 1.91
BECN1-211ENST00000589636 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.93■■□□□ 1.9
BECN1-211ENST00000589636 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa26.91■■□□□ 1.9
BECN1-211ENST00000589636 PBRM1Q86U86 1689 aa26.85■■□□□ 1.89
BECN1-211ENST00000589636 CHD1O14646 1710 aa26.85■■□□□ 1.89
BECN1-211ENST00000589636 SYNJ2O15056 1496 aa26.82■■□□□ 1.88
BECN1-211ENST00000589636 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.78■■□□□ 1.88
BECN1-211ENST00000589636 FBLN2P98095 1184 aa26.76■■□□□ 1.87
BECN1-211ENST00000589636 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
BECN1-211ENST00000589636 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.69■■□□□ 1.86
BECN1-211ENST00000589636 ADAMTS12P58397 1594 aa26.69■■□□□ 1.86
BECN1-211ENST00000589636 IGF1RP08069 1367 aa26.68■■□□□ 1.86
BECN1-211ENST00000589636 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.67■■□□□ 1.86
BECN1-211ENST00000589636 KIF27Q86VH2 1401 aa26.65■■□□□ 1.86
BECN1-211ENST00000589636 GRIN2AQ12879 1464 aa26.63■■□□□ 1.85
BECN1-211ENST00000589636 NUP160Q12769 1436 aa26.59■■□□□ 1.85
BECN1-211ENST00000589636 ARHGEF11O15085 1522 aa26.58■■□□□ 1.85
BECN1-211ENST00000589636 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa26.57■■□□□ 1.84
BECN1-211ENST00000589636 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa26.57■■□□□ 1.84
BECN1-211ENST00000589636 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa26.57■■□□□ 1.84
BECN1-211ENST00000589636 TRIM41Q8WV44 630 aa26.52■■□□□ 1.84
BECN1-211ENST00000589636 CEP170Q5SW79 1584 aa26.51■■□□□ 1.83
BECN1-211ENST00000589636 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa26.48■■□□□ 1.83
BECN1-211ENST00000589636 CUL7Q14999 1698 aa26.46■■□□□ 1.83
BECN1-211ENST00000589636 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa26.44■■□□□ 1.82
BECN1-211ENST00000589636 ARAP1Q96P48 1450 aa26.39■■□□□ 1.82
BECN1-211ENST00000589636 SHROOM2Q13796 1616 aa26.38■■□□□ 1.81
BECN1-211ENST00000589636 CYB5RLQ6IPT4 315 aa26.32■■□□□ 1.8
BECN1-211ENST00000589636 JPH4Q96JJ6 628 aa26.31■■□□□ 1.8
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