Protein–RNA interactions for Protein: Q13573

SNW1, SNW domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNW1Q13573 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SNW1Q13573 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
SNW1Q13573 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
SNW1Q13573 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
SNW1Q13573 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNW1Q13573 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNW1Q13573 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNW1Q13573 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNW1Q13573 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNW1Q13573 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNW1Q13573 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNW1Q13573 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNW1Q13573 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SNW1Q13573 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms