RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568104.5

BBS2-218, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene BBS2, Length 2,623 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2-218ENST00000568104 NISCHQ9Y2I1 1504 aa35.04■■■■□ 3.2
BBS2-218ENST00000568104 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa30.03■■■□□ 2.4
BBS2-218ENST00000568104 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP29.59■■■□□ 2.33
BBS2-218ENST00000568104 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa29.43■■■□□ 2.3
BBS2-218ENST00000568104 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.92■■■□□ 2.22
BBS2-218ENST00000568104 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa28.86■■■□□ 2.21
BBS2-218ENST00000568104 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.74■■■□□ 2.19
BBS2-218ENST00000568104 MYO15BQ96JP2 1530 aa28.17■■■□□ 2.1
BBS2-218ENST00000568104 SCRIBQ14160 1630 aa27.93■■■□□ 2.06
BBS2-218ENST00000568104 CHIC1Q5VXU3 224 aa27.88■■■□□ 2.05
BBS2-218ENST00000568104 ABCC9O60706 1549 aa27.86■■■□□ 2.05
BBS2-218ENST00000568104 NACADO15069 1562 aa27.81■■■□□ 2.04
BBS2-218ENST00000568104 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP27.57■■■□□ 2
BBS2-218ENST00000568104 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa27.4■■□□□ 1.98
BBS2-218ENST00000568104 CECR2Q9BXF3 1484 aa27.25■■□□□ 1.95
BBS2-218ENST00000568104 MROH2BQ7Z745 1585 aa27.16■■□□□ 1.94
BBS2-218ENST00000568104 WIZO95785 1651 aa27■■□□□ 1.91
BBS2-218ENST00000568104 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
BBS2-218ENST00000568104 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa26.95■■□□□ 1.9
BBS2-218ENST00000568104 UNC13AQ9UPW8 1703 aa26.92■■□□□ 1.9
BBS2-218ENST00000568104 TRIM41Q8WV44 630 aa26.89■■□□□ 1.9
BBS2-218ENST00000568104 SMARCA4P51532 1647 aa26.75■■□□□ 1.87
BBS2-218ENST00000568104 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP26.66■■□□□ 1.86
BBS2-218ENST00000568104 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.64■■□□□ 1.85
BBS2-218ENST00000568104 BICRAQ9NZM4 1560 aa26.6■■□□□ 1.85
BBS2-218ENST00000568104 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
BBS2-218ENST00000568104 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP26.53■■□□□ 1.84
BBS2-218ENST00000568104 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
BBS2-218ENST00000568104 HRCP23327 699 aa26.5■■□□□ 1.83
BBS2-218ENST00000568104 CCDC88BA6NC98 1476 aa26.48■■□□□ 1.83
BBS2-218ENST00000568104 SMARCA2P51531 1590 aa26.47■■□□□ 1.83
BBS2-218ENST00000568104 PEG3Q9GZU2 1588 aa26.32■■□□□ 1.8
BBS2-218ENST00000568104 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP26.32■■□□□ 1.8
BBS2-218ENST00000568104 ABCC8Q09428 1581 aa26.25■■□□□ 1.79
BBS2-218ENST00000568104 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.22■■□□□ 1.79
BBS2-218ENST00000568104 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa26.12■■□□□ 1.77
BBS2-218ENST00000568104 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
BBS2-218ENST00000568104 SOGA1O94964 1423 aa25.94■■□□□ 1.74
BBS2-218ENST00000568104 EEA1Q15075 1411 aa25.93■■□□□ 1.74
BBS2-218ENST00000568104 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP25.92■■□□□ 1.74
BBS2-218ENST00000568104 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
BBS2-218ENST00000568104 CSRNP3Q8WYN3 585 aa25.82■■□□□ 1.72
BBS2-218ENST00000568104 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa25.8■■□□□ 1.72
BBS2-218ENST00000568104 SYNJ1O43426 1573 aa25.78■■□□□ 1.72
BBS2-218ENST00000568104 TNIKQ9UKE5 1360 aa25.76■■□□□ 1.71
BBS2-218ENST00000568104 CEP162Q5TB80 1403 aa25.73■■□□□ 1.71
BBS2-218ENST00000568104 HMGXB3Q12766 1538 aa25.71■■□□□ 1.71
BBS2-218ENST00000568104 NCAPD3P42695 1498 aa25.71■■□□□ 1.71
BBS2-218ENST00000568104 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
BBS2-218ENST00000568104 GOLGA3Q08378 1498 aa25.67■■□□□ 1.7
BBS2-218ENST00000568104 UBTFP17480 764 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.69
BBS2-218ENST00000568104 CEP164Q9UPV0 1460 aa25.57■■□□□ 1.68
BBS2-218ENST00000568104 TOP2BQ02880 1626 aa25.56■■□□□ 1.68
BBS2-218ENST00000568104 KIF21BO75037 1637 aa25.55■■□□□ 1.68
BBS2-218ENST00000568104 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa25.48■■□□□ 1.67
BBS2-218ENST00000568104 CFTRP13569 1480 aa25.4■■□□□ 1.66
BBS2-218ENST00000568104 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa25.35■■□□□ 1.65
BBS2-218ENST00000568104 CLIP1P30622 1438 aa25.33■■□□□ 1.65
BBS2-218ENST00000568104 CUX1P39880 1505 aa25.32■■□□□ 1.64
BBS2-218ENST00000568104 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
BBS2-218ENST00000568104 PRDM2Q13029 1718 aa25.23■■□□□ 1.63
BBS2-218ENST00000568104 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
BBS2-218ENST00000568104 ERICH3Q5RHP9 1530 aa25.22■■□□□ 1.63
BBS2-218ENST00000568104 PRXQ9BXM0 1461 aa25.2■■□□□ 1.63
BBS2-218ENST00000568104 VPS8Q8N3P4 1428 aa25.2■■□□□ 1.62
BBS2-218ENST00000568104 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
BBS2-218ENST00000568104 KIF27Q86VH2 1401 aa25.17■■□□□ 1.62
BBS2-218ENST00000568104 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa25.16■■□□□ 1.62
BBS2-218ENST00000568104 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.16■■□□□ 1.62
BBS2-218ENST00000568104 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
BBS2-218ENST00000568104 APLP2Q06481 763 aa25.05■■□□□ 1.6
BBS2-218ENST00000568104 ARAP1Q96P48 1450 aa24.95■■□□□ 1.58
BBS2-218ENST00000568104 CUX2O14529 1486 aa24.95■■□□□ 1.58
BBS2-218ENST00000568104 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.92■■□□□ 1.58
BBS2-218ENST00000568104 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.9■■□□□ 1.58
BBS2-218ENST00000568104 IGF1RP08069 1367 aa24.89■■□□□ 1.57
BBS2-218ENST00000568104 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
BBS2-218ENST00000568104 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa24.79■■□□□ 1.56
BBS2-218ENST00000568104 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa24.78■■□□□ 1.56
BBS2-218ENST00000568104 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.78■■□□□ 1.56
BBS2-218ENST00000568104 NESP48681 1621 aa24.74■■□□□ 1.55
BBS2-218ENST00000568104 TOPBP1Q92547 1522 aa24.71■■□□□ 1.55
BBS2-218ENST00000568104 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.55
BBS2-218ENST00000568104 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.67■■□□□ 1.54
BBS2-218ENST00000568104 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa24.67■■□□□ 1.54
BBS2-218ENST00000568104 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
BBS2-218ENST00000568104 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.66■■□□□ 1.54
BBS2-218ENST00000568104 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.53
BBS2-218ENST00000568104 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
BBS2-218ENST00000568104 MAP3K1Q13233 1512 aa24.53■■□□□ 1.52
BBS2-218ENST00000568104 CUL7Q14999 1698 aa24.53■■□□□ 1.52
BBS2-218ENST00000568104 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
BBS2-218ENST00000568104 PDS5BQ9NTI5 1447 aa24.51■■□□□ 1.51
BBS2-218ENST00000568104 TIAM1Q13009 1591 aa24.5■■□□□ 1.51
BBS2-218ENST00000568104 FHAD1B1AJZ9 1412 aa24.48■■□□□ 1.51
BBS2-218ENST00000568104 WDR97A6NE52 1622 aa24.47■■□□□ 1.51
BBS2-218ENST00000568104 CCNB3Q8WWL7 1395 aa24.47■■□□□ 1.51
BBS2-218ENST00000568104 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
BBS2-218ENST00000568104 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.43■■□□□ 1.5
BBS2-218ENST00000568104 CLSPNQ9HAW4 1339 aa24.42■■□□□ 1.5
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