Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NAE1Q13564 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NAE1Q13564 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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