RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291592.5

LRRC3-201, Transcript of leucine rich repeat containing 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRC3, Length 5,869 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC3-201ENST00000291592 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.64■■■□□ 2.18
LRRC3-201ENST00000291592 NISCHQ9Y2I1 1504 aa28.35■■■□□ 2.13
LRRC3-201ENST00000291592 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
LRRC3-201ENST00000291592 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27■■□□□ 1.91
LRRC3-201ENST00000291592 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.85■■□□□ 1.89
LRRC3-201ENST00000291592 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.2■■□□□ 1.79
LRRC3-201ENST00000291592 APLP2Q06481 763 aa25.86■■□□□ 1.73
LRRC3-201ENST00000291592 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.83■■□□□ 1.72
LRRC3-201ENST00000291592 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
LRRC3-201ENST00000291592 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
LRRC3-201ENST00000291592 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
LRRC3-201ENST00000291592 PCGF6Q9BYE7 350 aa25.45■■□□□ 1.66
LRRC3-201ENST00000291592 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
LRRC3-201ENST00000291592 TRIM41Q8WV44 630 aa25.26■■□□□ 1.63
LRRC3-201ENST00000291592 MYT1Q01538 1121 aa25.26■■□□□ 1.63
LRRC3-201ENST00000291592 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.63
LRRC3-201ENST00000291592 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
LRRC3-201ENST00000291592 NEFLP07196 543 aa25.08■■□□□ 1.61
LRRC3-201ENST00000291592 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.91■■□□□ 1.58
LRRC3-201ENST00000291592 UBTFP17480 764 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
LRRC3-201ENST00000291592 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
LRRC3-201ENST00000291592 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
LRRC3-201ENST00000291592 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.45■■□□□ 1.5
LRRC3-201ENST00000291592 CHIC1Q5VXU3 224 aa24.36■■□□□ 1.49
LRRC3-201ENST00000291592 ABCC9O60706 1549 aa24.31■■□□□ 1.48
LRRC3-201ENST00000291592 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.27■■□□□ 1.47
LRRC3-201ENST00000291592 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.47
LRRC3-201ENST00000291592 HRCP23327 699 aa24.23■■□□□ 1.47
LRRC3-201ENST00000291592 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.13■■□□□ 1.45
LRRC3-201ENST00000291592 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.08■■□□□ 1.45
LRRC3-201ENST00000291592 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP24.03■■□□□ 1.44
LRRC3-201ENST00000291592 ITGAEP38570 1179 aa24■■□□□ 1.43
LRRC3-201ENST00000291592 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.43
LRRC3-201ENST00000291592 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.43
LRRC3-201ENST00000291592 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
LRRC3-201ENST00000291592 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
LRRC3-201ENST00000291592 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.85■■□□□ 1.41
LRRC3-201ENST00000291592 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.83■■□□□ 1.4
LRRC3-201ENST00000291592 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.38
LRRC3-201ENST00000291592 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
LRRC3-201ENST00000291592 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
LRRC3-201ENST00000291592 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
LRRC3-201ENST00000291592 SCRIBQ14160 1630 aa23.46■■□□□ 1.35
LRRC3-201ENST00000291592 BCANQ96GW7 911 aa23.44■■□□□ 1.34
LRRC3-201ENST00000291592 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.39■■□□□ 1.34
LRRC3-201ENST00000291592 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
LRRC3-201ENST00000291592 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.34■■□□□ 1.33
LRRC3-201ENST00000291592 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
LRRC3-201ENST00000291592 TRIM52Q96A61 297 aa23.26■■□□□ 1.31
LRRC3-201ENST00000291592 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.24■■□□□ 1.31
LRRC3-201ENST00000291592 FBLN2P98095 1184 aa23.21■■□□□ 1.31
LRRC3-201ENST00000291592 NEUROD1Q13562 356 aa23.18■■□□□ 1.3
LRRC3-201ENST00000291592 ANP32CO43423 234 aa23.18■■□□□ 1.3
LRRC3-201ENST00000291592 P3H3Q8IVL6 736 aa23.11■■□□□ 1.29
LRRC3-201ENST00000291592 CANXP27824 592 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
LRRC3-201ENST00000291592 BCL11AQ9H165 835 aa23.04■■□□□ 1.28
LRRC3-201ENST00000291592 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
LRRC3-201ENST00000291592 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
LRRC3-201ENST00000291592 ARID3CA6NKF2 412 aa22.98■■□□□ 1.27
LRRC3-201ENST00000291592 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
LRRC3-201ENST00000291592 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
LRRC3-201ENST00000291592 SLC24A1O60721 1099 aa22.91■■□□□ 1.26
LRRC3-201ENST00000291592 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
LRRC3-201ENST00000291592 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa22.85■■□□□ 1.25
LRRC3-201ENST00000291592 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
LRRC3-201ENST00000291592 NEFMP07197 916 aa22.83■■□□□ 1.24
LRRC3-201ENST00000291592 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
LRRC3-201ENST00000291592 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.74■■□□□ 1.23
LRRC3-201ENST00000291592 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa22.74■■□□□ 1.23
LRRC3-201ENST00000291592 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
LRRC3-201ENST00000291592 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
LRRC3-201ENST00000291592 NACADO15069 1562 aa22.65■■□□□ 1.22
LRRC3-201ENST00000291592 FKBP8Q14318 412 aa22.63■■□□□ 1.21
LRRC3-201ENST00000291592 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
LRRC3-201ENST00000291592 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
LRRC3-201ENST00000291592 TONSLQ96HA7 1378 aa22.48■■□□□ 1.19
LRRC3-201ENST00000291592 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.47■■□□□ 1.19
LRRC3-201ENST00000291592 NBR1Q14596 966 aa22.47■■□□□ 1.19
LRRC3-201ENST00000291592 CLIP1P30622 1438 aa22.46■■□□□ 1.19
LRRC3-201ENST00000291592 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP22.44■■□□□ 1.18
LRRC3-201ENST00000291592 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
LRRC3-201ENST00000291592 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.42■■□□□ 1.18
LRRC3-201ENST00000291592 ARXQ96QS3 562 aa22.4■■□□□ 1.18
LRRC3-201ENST00000291592 EEA1Q15075 1411 aa22.38■■□□□ 1.17
LRRC3-201ENST00000291592 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP22.38■■□□□ 1.17
LRRC3-201ENST00000291592 MTUS2Q5JR59 1369 aa22.37■■□□□ 1.17
LRRC3-201ENST00000291592 GOLGA3Q08378 1498 aa22.37■■□□□ 1.17
LRRC3-201ENST00000291592 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
LRRC3-201ENST00000291592 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.36■■□□□ 1.17
LRRC3-201ENST00000291592 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP22.35■■□□□ 1.17
LRRC3-201ENST00000291592 CCDC136Q96JN2 1154 aa22.34■■□□□ 1.17
LRRC3-201ENST00000291592 CEP162Q5TB80 1403 aa22.32■■□□□ 1.16
LRRC3-201ENST00000291592 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
LRRC3-201ENST00000291592 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
LRRC3-201ENST00000291592 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
LRRC3-201ENST00000291592 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
LRRC3-201ENST00000291592 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
LRRC3-201ENST00000291592 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.26■■□□□ 1.15
LRRC3-201ENST00000291592 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
LRRC3-201ENST00000291592 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 6.6 ms