Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
SMIM1B2RUZ4 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms