RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513272.5

TMA16-209, Transcript of translation machinery associated 16 homolog, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TMA16, Length 803 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMA16-209ENST00000513272 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.94■■■■■ 5.1
TMA16-209ENST00000513272 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.91■■■■■ 4.3
TMA16-209ENST00000513272 ABCC9O60706 1549 aa41.68■■■■■ 4.26
TMA16-209ENST00000513272 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.77■■■■□ 3.96
TMA16-209ENST00000513272 DCAF8L2P0C7V8 631 aa39.6■■■■□ 3.93
TMA16-209ENST00000513272 NACADO15069 1562 aa39.58■■■■□ 3.93
TMA16-209ENST00000513272 MYO15BQ96JP2 1530 aa39.13■■■■□ 3.85
TMA16-209ENST00000513272 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.96■■■■□ 3.83
TMA16-209ENST00000513272 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.9■■■■□ 3.82
TMA16-209ENST00000513272 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.81■■■■□ 3.8
TMA16-209ENST00000513272 DNAJC5BQ9UF47 199 aa38.8■■■■□ 3.8
TMA16-209ENST00000513272 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.76■■■■□ 3.8
TMA16-209ENST00000513272 BICRAQ9NZM4 1560 aa38.59■■■■□ 3.77
TMA16-209ENST00000513272 SCRIBQ14160 1630 aa38.28■■■■□ 3.72
TMA16-209ENST00000513272 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa38.09■■■■□ 3.69
TMA16-209ENST00000513272 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP37.63■■■■□ 3.61
TMA16-209ENST00000513272 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa37.62■■■■□ 3.61
TMA16-209ENST00000513272 CECR2Q9BXF3 1484 aa37.5■■■■□ 3.59
TMA16-209ENST00000513272 NCAPD3P42695 1498 aa36.56■■■■□ 3.44
TMA16-209ENST00000513272 SMARCA4P51532 1647 aa36.52■■■■□ 3.44
TMA16-209ENST00000513272 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36.5■■■■□ 3.43
TMA16-209ENST00000513272 SMARCA2P51531 1590 aa36.4■■■■□ 3.42
TMA16-209ENST00000513272 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.4■■■■□ 3.42
TMA16-209ENST00000513272 HMGXB3Q12766 1538 aa36.29■■■■□ 3.4
TMA16-209ENST00000513272 MROH2BQ7Z745 1585 aa36.19■■■■□ 3.38
TMA16-209ENST00000513272 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP36.18■■■■□ 3.38
TMA16-209ENST00000513272 PEG3Q9GZU2 1588 aa36.15■■■■□ 3.38
TMA16-209ENST00000513272 ERCC6Q03468 1493 aa35.97■■■■□ 3.35
TMA16-209ENST00000513272 NESP48681 1621 aa35.89■■■■□ 3.34
TMA16-209ENST00000513272 WIZO95785 1651 aa35.75■■■■□ 3.31
TMA16-209ENST00000513272 CUX2O14529 1486 aa35.73■■■■□ 3.31
TMA16-209ENST00000513272 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.65■■■■□ 3.3
TMA16-209ENST00000513272 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.57■■■■□ 3.29
TMA16-209ENST00000513272 CADPSQ9ULU8 1353 aa35.49■■■■□ 3.27
TMA16-209ENST00000513272 PDS5BQ9NTI5 1447 aa35.49■■■■□ 3.27
TMA16-209ENST00000513272 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP35.4■■■■□ 3.26
TMA16-209ENST00000513272 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa35.38■■■■□ 3.25
TMA16-209ENST00000513272 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa35.37■■■■□ 3.25
TMA16-209ENST00000513272 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.32■■■■□ 3.24
TMA16-209ENST00000513272 MRC2Q9UBG0 1479 aa35.14■■■■□ 3.22
TMA16-209ENST00000513272 CFTRP13569 1480 aa35.13■■■■□ 3.21
TMA16-209ENST00000513272 FANCD2Q9BXW9 1451 aa35.08■■■■□ 3.21
TMA16-209ENST00000513272 CEP164Q9UPV0 1460 aa35.08■■■■□ 3.21
TMA16-209ENST00000513272 WDR62O43379 1518 aa35.01■■■■□ 3.2
TMA16-209ENST00000513272 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.95■■■■□ 3.19
TMA16-209ENST00000513272 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.76■■■■□ 3.15
TMA16-209ENST00000513272 PRDM2Q13029 1718 aa34.72■■■■□ 3.15
TMA16-209ENST00000513272 TOPBP1Q92547 1522 aa34.44■■■■□ 3.1
TMA16-209ENST00000513272 ABCC8Q09428 1581 aa34.38■■■■□ 3.09
TMA16-209ENST00000513272 IFT140Q96RY7 1462 aa34.36■■■■□ 3.09
TMA16-209ENST00000513272 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.34■■■■□ 3.09
TMA16-209ENST00000513272 DNMBPQ6XZF7 1577 aa34.32■■■■□ 3.09
TMA16-209ENST00000513272 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP34.29■■■■□ 3.08
TMA16-209ENST00000513272 OSCARQ8IYS5 282 aa34.23■■■■□ 3.07
TMA16-209ENST00000513272 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP34.11■■■■□ 3.05
TMA16-209ENST00000513272 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP34.08■■■■□ 3.05
TMA16-209ENST00000513272 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP34.07■■■■□ 3.05
TMA16-209ENST00000513272 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP34.04■■■■□ 3.045e-7■■■■□ 21
TMA16-209ENST00000513272 TRIM41Q8WV44 630 aa34.01■■■■□ 3.03
TMA16-209ENST00000513272 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa34.01■■■■□ 3.03
TMA16-209ENST00000513272 SOGA1O94964 1423 aa33.99■■■■□ 3.03
TMA16-209ENST00000513272 CUX1P39880 1505 aa33.97■■■■□ 3.03
TMA16-209ENST00000513272 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.95■■■■□ 3.03
TMA16-209ENST00000513272 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.9■■■■□ 3.02
TMA16-209ENST00000513272 FBLN2P98095 1184 aa33.8■■■■□ 3
TMA16-209ENST00000513272 CHD1O14646 1710 aa33.73■■■□□ 2.99
TMA16-209ENST00000513272 WDR97A6NE52 1622 aa33.73■■■□□ 2.99
TMA16-209ENST00000513272 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.68■■■□□ 2.98
TMA16-209ENST00000513272 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa33.68■■■□□ 2.98
TMA16-209ENST00000513272 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa33.68■■■□□ 2.98
TMA16-209ENST00000513272 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa33.68■■■□□ 2.98
TMA16-209ENST00000513272 GRIN2BQ13224 1484 aa33.63■■■□□ 2.97
TMA16-209ENST00000513272 ARHGEF11O15085 1522 aa33.63■■■□□ 2.97
TMA16-209ENST00000513272 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.59■■■□□ 2.97
TMA16-209ENST00000513272 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP33.58■■■□□ 2.97
TMA16-209ENST00000513272 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.58■■■□□ 2.97
TMA16-209ENST00000513272 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.57■■■□□ 2.97
TMA16-209ENST00000513272 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.57■■■□□ 2.96
TMA16-209ENST00000513272 TOP2BQ02880 1626 aa33.5■■■□□ 2.95
TMA16-209ENST00000513272 SYNJ2O15056 1496 aa33.49■■■□□ 2.95
TMA16-209ENST00000513272 SYNJ1O43426 1573 aa33.48■■■□□ 2.95
TMA16-209ENST00000513272 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.48■■■□□ 2.95
TMA16-209ENST00000513272 PBRM1Q86U86 1689 aa33.47■■■□□ 2.95
TMA16-209ENST00000513272 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.46■■■□□ 2.95
TMA16-209ENST00000513272 CYB5RLQ6IPT4 315 aa33.43■■■□□ 2.94
TMA16-209ENST00000513272 CLASP1Q7Z460 1538 aa33.38■■■□□ 2.93
TMA16-209ENST00000513272 ARAP1Q96P48 1450 aa33.31■■■□□ 2.92
TMA16-209ENST00000513272 GRIN2AQ12879 1464 aa33.2■■■□□ 2.91
TMA16-209ENST00000513272 ADAMTS12P58397 1594 aa33.2■■■□□ 2.91
TMA16-209ENST00000513272 FHAD1B1AJZ9 1412 aa33.16■■■□□ 2.9
TMA16-209ENST00000513272 ERICH3Q5RHP9 1530 aa33.15■■■□□ 2.9
TMA16-209ENST00000513272 NUP160Q12769 1436 aa33.06■■■□□ 2.88
TMA16-209ENST00000513272 CEP170Q5SW79 1584 aa33.05■■■□□ 2.88
TMA16-209ENST00000513272 TRHP20396 242 aaPredicted RBP32.96■■■□□ 2.87
TMA16-209ENST00000513272 KIF27Q86VH2 1401 aa32.91■■■□□ 2.86
TMA16-209ENST00000513272 ERCC6L2Q5T890 1561 aa32.91■■■□□ 2.86
TMA16-209ENST00000513272 IGF1RP08069 1367 aa32.85■■■□□ 2.85
TMA16-209ENST00000513272 SHROOM2Q13796 1616 aa32.84■■■□□ 2.85
TMA16-209ENST00000513272 JPH4Q96JJ6 628 aa32.78■■■□□ 2.84
TMA16-209ENST00000513272 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP32.76■■■□□ 2.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.8 ms