Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GPAT3Q53EU6 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms