Protein–RNA interactions for Protein: P02654

APOC1, Apolipoprotein C-I, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC1P02654 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
APOC1P02654 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
APOC1P02654 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOC1P02654 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
APOC1P02654 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
APOC1P02654 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.05■□□□□ 0
APOC1P02654 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
APOC1P02654 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
APOC1P02654 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOC1P02654 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOC1P02654 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOC1P02654 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APOC1P02654 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
APOC1P02654 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APOC1P02654 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOC1P02654 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOC1P02654 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.05■□□□□ -0
APOC1P02654 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APOC1P02654 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOC1P02654 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOC1P02654 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APOC1P02654 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APOC1P02654 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
APOC1P02654 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
APOC1P02654 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APOC1P02654 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APOC1P02654 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOC1P02654 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOC1P02654 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOC1P02654 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOC1P02654 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOC1P02654 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOC1P02654 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOC1P02654 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
APOC1P02654 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOC1P02654 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOC1P02654 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOC1P02654 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOC1P02654 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOC1P02654 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
APOC1P02654 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
APOC1P02654 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC1P02654 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOC1P02654 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC1P02654 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC1P02654 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOC1P02654 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC1P02654 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC1P02654 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOC1P02654 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC1P02654 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.04■□□□□ -0
APOC1P02654 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOC1P02654 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC1P02654 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC1P02654 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.04■□□□□ -0
APOC1P02654 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC1P02654 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOC1P02654 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC1P02654 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC1P02654 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
APOC1P02654 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOC1P02654 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC1P02654 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC1P02654 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
APOC1P02654 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC1P02654 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOC1P02654 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.04■□□□□ -0
APOC1P02654 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.04■□□□□ -0
APOC1P02654 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOC1P02654 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC1P02654 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
APOC1P02654 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC1P02654 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOC1P02654 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC1P02654 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC1P02654 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC1P02654 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC1P02654 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.04■□□□□ -0
APOC1P02654 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC1P02654 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC1P02654 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOC1P02654 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC1P02654 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC1P02654 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
APOC1P02654 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
APOC1P02654 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
APOC1P02654 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
APOC1P02654 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms