Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
IGSF9BQ9UPX0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IGSF9BQ9UPX0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IGSF9BQ9UPX0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IGSF9BQ9UPX0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IGSF9BQ9UPX0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
IGSF9BQ9UPX0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
IGSF9BQ9UPX0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IGSF9BQ9UPX0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
IGSF9BQ9UPX0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
IGSF9BQ9UPX0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.91
IGSF9BQ9UPX0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
IGSF9BQ9UPX0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
IGSF9BQ9UPX0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
IGSF9BQ9UPX0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
IGSF9BQ9UPX0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IGSF9BQ9UPX0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
IGSF9BQ9UPX0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
IGSF9BQ9UPX0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
IGSF9BQ9UPX0 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
IGSF9BQ9UPX0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IGSF9BQ9UPX0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IGSF9BQ9UPX0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
IGSF9BQ9UPX0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
IGSF9BQ9UPX0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
IGSF9BQ9UPX0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IGSF9BQ9UPX0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
IGSF9BQ9UPX0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
IGSF9BQ9UPX0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
IGSF9BQ9UPX0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
IGSF9BQ9UPX0 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IGSF9BQ9UPX0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
IGSF9BQ9UPX0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
IGSF9BQ9UPX0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
IGSF9BQ9UPX0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IGSF9BQ9UPX0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
IGSF9BQ9UPX0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
IGSF9BQ9UPX0 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
IGSF9BQ9UPX0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IGSF9BQ9UPX0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IGSF9BQ9UPX0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IGSF9BQ9UPX0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IGSF9BQ9UPX0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
IGSF9BQ9UPX0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
IGSF9BQ9UPX0 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
IGSF9BQ9UPX0 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.89
IGSF9BQ9UPX0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
IGSF9BQ9UPX0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGSF9BQ9UPX0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGSF9BQ9UPX0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGSF9BQ9UPX0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGSF9BQ9UPX0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGSF9BQ9UPX0 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGSF9BQ9UPX0 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGSF9BQ9UPX0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGSF9BQ9UPX0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGSF9BQ9UPX0 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
IGSF9BQ9UPX0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IGSF9BQ9UPX0 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IGSF9BQ9UPX0 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
IGSF9BQ9UPX0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
IGSF9BQ9UPX0 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
IGSF9BQ9UPX0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IGSF9BQ9UPX0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IGSF9BQ9UPX0 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
IGSF9BQ9UPX0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IGSF9BQ9UPX0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
IGSF9BQ9UPX0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
IGSF9BQ9UPX0 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
IGSF9BQ9UPX0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
IGSF9BQ9UPX0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IGSF9BQ9UPX0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
IGSF9BQ9UPX0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IGSF9BQ9UPX0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
IGSF9BQ9UPX0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IGSF9BQ9UPX0 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IGSF9BQ9UPX0 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
IGSF9BQ9UPX0 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
IGSF9BQ9UPX0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGSF9BQ9UPX0 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGSF9BQ9UPX0 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGSF9BQ9UPX0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGSF9BQ9UPX0 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGSF9BQ9UPX0 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGSF9BQ9UPX0 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGSF9BQ9UPX0 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGSF9BQ9UPX0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGSF9BQ9UPX0 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
IGSF9BQ9UPX0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
IGSF9BQ9UPX0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
IGSF9BQ9UPX0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGSF9BQ9UPX0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGSF9BQ9UPX0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
IGSF9BQ9UPX0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
IGSF9BQ9UPX0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGSF9BQ9UPX0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGSF9BQ9UPX0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGSF9BQ9UPX0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGSF9BQ9UPX0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
IGSF9BQ9UPX0 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms