Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK11

ZNF223, Zinc finger protein 223, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF223Q9UK11 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF223Q9UK11 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF223Q9UK11 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF223Q9UK11 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF223Q9UK11 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF223Q9UK11 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF223Q9UK11 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF223Q9UK11 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF223Q9UK11 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF223Q9UK11 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF223Q9UK11 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF223Q9UK11 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF223Q9UK11 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF223Q9UK11 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF223Q9UK11 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF223Q9UK11 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF223Q9UK11 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF223Q9UK11 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF223Q9UK11 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF223Q9UK11 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF223Q9UK11 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF223Q9UK11 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF223Q9UK11 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF223Q9UK11 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF223Q9UK11 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF223Q9UK11 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF223Q9UK11 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF223Q9UK11 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF223Q9UK11 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF223Q9UK11 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF223Q9UK11 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF223Q9UK11 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF223Q9UK11 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF223Q9UK11 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF223Q9UK11 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF223Q9UK11 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF223Q9UK11 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF223Q9UK11 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF223Q9UK11 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF223Q9UK11 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF223Q9UK11 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF223Q9UK11 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF223Q9UK11 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF223Q9UK11 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF223Q9UK11 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF223Q9UK11 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF223Q9UK11 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF223Q9UK11 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF223Q9UK11 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF223Q9UK11 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ZNF223Q9UK11 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF223Q9UK11 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF223Q9UK11 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF223Q9UK11 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF223Q9UK11 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF223Q9UK11 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF223Q9UK11 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF223Q9UK11 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZNF223Q9UK11 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF223Q9UK11 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF223Q9UK11 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF223Q9UK11 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZNF223Q9UK11 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF223Q9UK11 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF223Q9UK11 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF223Q9UK11 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZNF223Q9UK11 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF223Q9UK11 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF223Q9UK11 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF223Q9UK11 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF223Q9UK11 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF223Q9UK11 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF223Q9UK11 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF223Q9UK11 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF223Q9UK11 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF223Q9UK11 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF223Q9UK11 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZNF223Q9UK11 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF223Q9UK11 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF223Q9UK11 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF223Q9UK11 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF223Q9UK11 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF223Q9UK11 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF223Q9UK11 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZNF223Q9UK11 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF223Q9UK11 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF223Q9UK11 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF223Q9UK11 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZNF223Q9UK11 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF223Q9UK11 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF223Q9UK11 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF223Q9UK11 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF223Q9UK11 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF223Q9UK11 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF223Q9UK11 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZNF223Q9UK11 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF223Q9UK11 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF223Q9UK11 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF223Q9UK11 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ZNF223Q9UK11 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms