Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYA4

MTMR4, Myotubularin-related protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR4Q9NYA4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTMR4Q9NYA4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTMR4Q9NYA4 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MTMR4Q9NYA4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MTMR4Q9NYA4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MTMR4Q9NYA4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MTMR4Q9NYA4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MTMR4Q9NYA4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MTMR4Q9NYA4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MTMR4Q9NYA4 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MTMR4Q9NYA4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MTMR4Q9NYA4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MTMR4Q9NYA4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
MTMR4Q9NYA4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MTMR4Q9NYA4 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MTMR4Q9NYA4 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTMR4Q9NYA4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTMR4Q9NYA4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTMR4Q9NYA4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTMR4Q9NYA4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTMR4Q9NYA4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTMR4Q9NYA4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTMR4Q9NYA4 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTMR4Q9NYA4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MTMR4Q9NYA4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MTMR4Q9NYA4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MTMR4Q9NYA4 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MTMR4Q9NYA4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MTMR4Q9NYA4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MTMR4Q9NYA4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MTMR4Q9NYA4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MTMR4Q9NYA4 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MTMR4Q9NYA4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MTMR4Q9NYA4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MTMR4Q9NYA4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MTMR4Q9NYA4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MTMR4Q9NYA4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MTMR4Q9NYA4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MTMR4Q9NYA4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MTMR4Q9NYA4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MTMR4Q9NYA4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MTMR4Q9NYA4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
MTMR4Q9NYA4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MTMR4Q9NYA4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MTMR4Q9NYA4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MTMR4Q9NYA4 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MTMR4Q9NYA4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MTMR4Q9NYA4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MTMR4Q9NYA4 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MTMR4Q9NYA4 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MTMR4Q9NYA4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MTMR4Q9NYA4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MTMR4Q9NYA4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MTMR4Q9NYA4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MTMR4Q9NYA4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MTMR4Q9NYA4 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MTMR4Q9NYA4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MTMR4Q9NYA4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MTMR4Q9NYA4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MTMR4Q9NYA4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MTMR4Q9NYA4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MTMR4Q9NYA4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MTMR4Q9NYA4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MTMR4Q9NYA4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MTMR4Q9NYA4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MTMR4Q9NYA4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MTMR4Q9NYA4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
MTMR4Q9NYA4 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
MTMR4Q9NYA4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MTMR4Q9NYA4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MTMR4Q9NYA4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
MTMR4Q9NYA4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTMR4Q9NYA4 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTMR4Q9NYA4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTMR4Q9NYA4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTMR4Q9NYA4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTMR4Q9NYA4 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTMR4Q9NYA4 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTMR4Q9NYA4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MTMR4Q9NYA4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MTMR4Q9NYA4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MTMR4Q9NYA4 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MTMR4Q9NYA4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MTMR4Q9NYA4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MTMR4Q9NYA4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MTMR4Q9NYA4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MTMR4Q9NYA4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MTMR4Q9NYA4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MTMR4Q9NYA4 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MTMR4Q9NYA4 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MTMR4Q9NYA4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MTMR4Q9NYA4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MTMR4Q9NYA4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MTMR4Q9NYA4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MTMR4Q9NYA4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
MTMR4Q9NYA4 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MTMR4Q9NYA4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MTMR4Q9NYA4 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MTMR4Q9NYA4 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MTMR4Q9NYA4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms