Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0I3

CCDC113, Coiled-coil domain-containing protein 113, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC113Q9H0I3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC113Q9H0I3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC113Q9H0I3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC113Q9H0I3 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC113Q9H0I3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC113Q9H0I3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC113Q9H0I3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC113Q9H0I3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC113Q9H0I3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC113Q9H0I3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC113Q9H0I3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC113Q9H0I3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC113Q9H0I3 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC113Q9H0I3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC113Q9H0I3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC113Q9H0I3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC113Q9H0I3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC113Q9H0I3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC113Q9H0I3 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC113Q9H0I3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC113Q9H0I3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC113Q9H0I3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC113Q9H0I3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCDC113Q9H0I3 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC113Q9H0I3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC113Q9H0I3 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC113Q9H0I3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC113Q9H0I3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC113Q9H0I3 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC113Q9H0I3 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC113Q9H0I3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC113Q9H0I3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC113Q9H0I3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC113Q9H0I3 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC113Q9H0I3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC113Q9H0I3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC113Q9H0I3 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC113Q9H0I3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC113Q9H0I3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC113Q9H0I3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC113Q9H0I3 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC113Q9H0I3 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC113Q9H0I3 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC113Q9H0I3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC113Q9H0I3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC113Q9H0I3 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC113Q9H0I3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC113Q9H0I3 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC113Q9H0I3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC113Q9H0I3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC113Q9H0I3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC113Q9H0I3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC113Q9H0I3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC113Q9H0I3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC113Q9H0I3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC113Q9H0I3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC113Q9H0I3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC113Q9H0I3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC113Q9H0I3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC113Q9H0I3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC113Q9H0I3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC113Q9H0I3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC113Q9H0I3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC113Q9H0I3 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC113Q9H0I3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC113Q9H0I3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC113Q9H0I3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC113Q9H0I3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC113Q9H0I3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC113Q9H0I3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC113Q9H0I3 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC113Q9H0I3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC113Q9H0I3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC113Q9H0I3 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC113Q9H0I3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC113Q9H0I3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC113Q9H0I3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC113Q9H0I3 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC113Q9H0I3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC113Q9H0I3 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC113Q9H0I3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC113Q9H0I3 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC113Q9H0I3 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC113Q9H0I3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC113Q9H0I3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC113Q9H0I3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC113Q9H0I3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC113Q9H0I3 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC113Q9H0I3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC113Q9H0I3 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC113Q9H0I3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC113Q9H0I3 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC113Q9H0I3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC113Q9H0I3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC113Q9H0I3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC113Q9H0I3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC113Q9H0I3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC113Q9H0I3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC113Q9H0I3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC113Q9H0I3 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms