Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOL6Q9BWW8 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOL6Q9BWW8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOL6Q9BWW8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
APOL6Q9BWW8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
APOL6Q9BWW8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOL6Q9BWW8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOL6Q9BWW8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOL6Q9BWW8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOL6Q9BWW8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
APOL6Q9BWW8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
APOL6Q9BWW8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOL6Q9BWW8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOL6Q9BWW8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOL6Q9BWW8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
APOL6Q9BWW8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOL6Q9BWW8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOL6Q9BWW8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOL6Q9BWW8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOL6Q9BWW8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOL6Q9BWW8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOL6Q9BWW8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOL6Q9BWW8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOL6Q9BWW8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOL6Q9BWW8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
APOL6Q9BWW8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOL6Q9BWW8 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOL6Q9BWW8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOL6Q9BWW8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOL6Q9BWW8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOL6Q9BWW8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
APOL6Q9BWW8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOL6Q9BWW8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOL6Q9BWW8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
APOL6Q9BWW8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOL6Q9BWW8 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
APOL6Q9BWW8 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOL6Q9BWW8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOL6Q9BWW8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
APOL6Q9BWW8 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOL6Q9BWW8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOL6Q9BWW8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
APOL6Q9BWW8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOL6Q9BWW8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOL6Q9BWW8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOL6Q9BWW8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOL6Q9BWW8 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOL6Q9BWW8 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOL6Q9BWW8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
APOL6Q9BWW8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOL6Q9BWW8 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOL6Q9BWW8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
APOL6Q9BWW8 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
APOL6Q9BWW8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
APOL6Q9BWW8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
APOL6Q9BWW8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
APOL6Q9BWW8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
APOL6Q9BWW8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOL6Q9BWW8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOL6Q9BWW8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
APOL6Q9BWW8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOL6Q9BWW8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOL6Q9BWW8 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOL6Q9BWW8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOL6Q9BWW8 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
APOL6Q9BWW8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOL6Q9BWW8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
APOL6Q9BWW8 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
APOL6Q9BWW8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOL6Q9BWW8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOL6Q9BWW8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOL6Q9BWW8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOL6Q9BWW8 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOL6Q9BWW8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
APOL6Q9BWW8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOL6Q9BWW8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOL6Q9BWW8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOL6Q9BWW8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOL6Q9BWW8 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOL6Q9BWW8 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOL6Q9BWW8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOL6Q9BWW8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOL6Q9BWW8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
APOL6Q9BWW8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOL6Q9BWW8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOL6Q9BWW8 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOL6Q9BWW8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
APOL6Q9BWW8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
APOL6Q9BWW8 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOL6Q9BWW8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOL6Q9BWW8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
APOL6Q9BWW8 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOL6Q9BWW8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
APOL6Q9BWW8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
APOL6Q9BWW8 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOL6Q9BWW8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOL6Q9BWW8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOL6Q9BWW8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOL6Q9BWW8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
APOL6Q9BWW8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms