Protein–RNA interactions for Protein: Q96KR1

ZFR, Zinc finger RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFRQ96KR1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
ZFRQ96KR1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZFRQ96KR1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZFRQ96KR1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZFRQ96KR1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZFRQ96KR1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZFRQ96KR1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZFRQ96KR1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZFRQ96KR1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFRQ96KR1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFRQ96KR1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFRQ96KR1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFRQ96KR1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFRQ96KR1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFRQ96KR1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFRQ96KR1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZFRQ96KR1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZFRQ96KR1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZFRQ96KR1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZFRQ96KR1 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ZFRQ96KR1 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
ZFRQ96KR1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZFRQ96KR1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZFRQ96KR1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZFRQ96KR1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZFRQ96KR1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZFRQ96KR1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZFRQ96KR1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZFRQ96KR1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZFRQ96KR1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZFRQ96KR1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ZFRQ96KR1 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZFRQ96KR1 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZFRQ96KR1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZFRQ96KR1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZFRQ96KR1 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZFRQ96KR1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZFRQ96KR1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZFRQ96KR1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZFRQ96KR1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZFRQ96KR1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZFRQ96KR1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZFRQ96KR1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZFRQ96KR1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZFRQ96KR1 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZFRQ96KR1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZFRQ96KR1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZFRQ96KR1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZFRQ96KR1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZFRQ96KR1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZFRQ96KR1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms